Protein–RNA interactions for Protein: Q99742

NPAS1, Neuronal PAS domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 590 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPAS1Q99742 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NPAS1Q99742 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NPAS1Q99742 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NPAS1Q99742 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NPAS1Q99742 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NPAS1Q99742 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NPAS1Q99742 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NPAS1Q99742 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NPAS1Q99742 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
NPAS1Q99742 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NPAS1Q99742 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NPAS1Q99742 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NPAS1Q99742 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NPAS1Q99742 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NPAS1Q99742 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NPAS1Q99742 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
NPAS1Q99742 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NPAS1Q99742 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NPAS1Q99742 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NPAS1Q99742 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NPAS1Q99742 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NPAS1Q99742 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NPAS1Q99742 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NPAS1Q99742 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NPAS1Q99742 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NPAS1Q99742 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NPAS1Q99742 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NPAS1Q99742 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NPAS1Q99742 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
NPAS1Q99742 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NPAS1Q99742 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NPAS1Q99742 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NPAS1Q99742 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NPAS1Q99742 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NPAS1Q99742 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NPAS1Q99742 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
NPAS1Q99742 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NPAS1Q99742 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NPAS1Q99742 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NPAS1Q99742 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NPAS1Q99742 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NPAS1Q99742 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NPAS1Q99742 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NPAS1Q99742 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NPAS1Q99742 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NPAS1Q99742 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
NPAS1Q99742 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NPAS1Q99742 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NPAS1Q99742 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NPAS1Q99742 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NPAS1Q99742 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NPAS1Q99742 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NPAS1Q99742 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NPAS1Q99742 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NPAS1Q99742 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
NPAS1Q99742 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NPAS1Q99742 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NPAS1Q99742 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NPAS1Q99742 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NPAS1Q99742 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NPAS1Q99742 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NPAS1Q99742 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NPAS1Q99742 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NPAS1Q99742 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
NPAS1Q99742 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NPAS1Q99742 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NPAS1Q99742 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NPAS1Q99742 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NPAS1Q99742 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NPAS1Q99742 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
NPAS1Q99742 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NPAS1Q99742 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NPAS1Q99742 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NPAS1Q99742 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NPAS1Q99742 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NPAS1Q99742 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NPAS1Q99742 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NPAS1Q99742 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NPAS1Q99742 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NPAS1Q99742 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NPAS1Q99742 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NPAS1Q99742 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NPAS1Q99742 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NPAS1Q99742 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NPAS1Q99742 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NPAS1Q99742 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NPAS1Q99742 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NPAS1Q99742 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NPAS1Q99742 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NPAS1Q99742 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NPAS1Q99742 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NPAS1Q99742 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NPAS1Q99742 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NPAS1Q99742 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NPAS1Q99742 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NPAS1Q99742 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NPAS1Q99742 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NPAS1Q99742 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NPAS1Q99742 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NPAS1Q99742 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.6 ms