Protein–RNA interactions for Protein: Q99708

RBBP8, DNA endonuclease RBBP8, humanhuman

Predictions only

Length 897 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBBP8Q99708 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RBBP8Q99708 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RBBP8Q99708 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RBBP8Q99708 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RBBP8Q99708 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RBBP8Q99708 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RBBP8Q99708 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RBBP8Q99708 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RBBP8Q99708 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RBBP8Q99708 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RBBP8Q99708 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RBBP8Q99708 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RBBP8Q99708 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RBBP8Q99708 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RBBP8Q99708 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RBBP8Q99708 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RBBP8Q99708 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RBBP8Q99708 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RBBP8Q99708 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RBBP8Q99708 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RBBP8Q99708 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RBBP8Q99708 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RBBP8Q99708 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RBBP8Q99708 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RBBP8Q99708 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RBBP8Q99708 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RBBP8Q99708 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RBBP8Q99708 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RBBP8Q99708 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RBBP8Q99708 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RBBP8Q99708 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RBBP8Q99708 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RBBP8Q99708 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RBBP8Q99708 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RBBP8Q99708 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RBBP8Q99708 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RBBP8Q99708 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RBBP8Q99708 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RBBP8Q99708 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RBBP8Q99708 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RBBP8Q99708 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RBBP8Q99708 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RBBP8Q99708 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RBBP8Q99708 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RBBP8Q99708 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RBBP8Q99708 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
RBBP8Q99708 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RBBP8Q99708 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RBBP8Q99708 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RBBP8Q99708 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RBBP8Q99708 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RBBP8Q99708 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RBBP8Q99708 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RBBP8Q99708 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RBBP8Q99708 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RBBP8Q99708 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RBBP8Q99708 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
RBBP8Q99708 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RBBP8Q99708 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RBBP8Q99708 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RBBP8Q99708 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RBBP8Q99708 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RBBP8Q99708 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RBBP8Q99708 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RBBP8Q99708 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RBBP8Q99708 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RBBP8Q99708 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RBBP8Q99708 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
RBBP8Q99708 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RBBP8Q99708 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RBBP8Q99708 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RBBP8Q99708 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RBBP8Q99708 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RBBP8Q99708 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RBBP8Q99708 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RBBP8Q99708 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RBBP8Q99708 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RBBP8Q99708 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RBBP8Q99708 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RBBP8Q99708 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RBBP8Q99708 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RBBP8Q99708 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RBBP8Q99708 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RBBP8Q99708 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RBBP8Q99708 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RBBP8Q99708 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RBBP8Q99708 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RBBP8Q99708 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RBBP8Q99708 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RBBP8Q99708 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RBBP8Q99708 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RBBP8Q99708 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RBBP8Q99708 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RBBP8Q99708 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RBBP8Q99708 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RBBP8Q99708 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RBBP8Q99708 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RBBP8Q99708 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RBBP8Q99708 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RBBP8Q99708 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms