Protein–RNA interactions for Protein: Q99567

NUP88, Nuclear pore complex protein Nup88, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 741 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP88Q99567 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NUP88Q99567 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
NUP88Q99567 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
NUP88Q99567 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
NUP88Q99567 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NUP88Q99567 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NUP88Q99567 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NUP88Q99567 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NUP88Q99567 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
NUP88Q99567 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
NUP88Q99567 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
NUP88Q99567 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
NUP88Q99567 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
NUP88Q99567 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
NUP88Q99567 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
NUP88Q99567 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
NUP88Q99567 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
NUP88Q99567 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
NUP88Q99567 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
NUP88Q99567 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
NUP88Q99567 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
NUP88Q99567 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
NUP88Q99567 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
NUP88Q99567 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
NUP88Q99567 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
NUP88Q99567 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
NUP88Q99567 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
NUP88Q99567 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
NUP88Q99567 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
NUP88Q99567 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
NUP88Q99567 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
NUP88Q99567 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
NUP88Q99567 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
NUP88Q99567 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
NUP88Q99567 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
NUP88Q99567 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
NUP88Q99567 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
NUP88Q99567 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
NUP88Q99567 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
NUP88Q99567 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
NUP88Q99567 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
NUP88Q99567 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
NUP88Q99567 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
NUP88Q99567 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
NUP88Q99567 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
NUP88Q99567 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
NUP88Q99567 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
NUP88Q99567 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
NUP88Q99567 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
NUP88Q99567 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
NUP88Q99567 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
NUP88Q99567 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
NUP88Q99567 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
NUP88Q99567 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
NUP88Q99567 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
NUP88Q99567 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
NUP88Q99567 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC21.08■□□□□ 0.97
NUP88Q99567 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
NUP88Q99567 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
NUP88Q99567 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
NUP88Q99567 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
NUP88Q99567 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
NUP88Q99567 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
NUP88Q99567 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
NUP88Q99567 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
NUP88Q99567 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
NUP88Q99567 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
NUP88Q99567 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
NUP88Q99567 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
NUP88Q99567 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
NUP88Q99567 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
NUP88Q99567 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
NUP88Q99567 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
NUP88Q99567 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
NUP88Q99567 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
NUP88Q99567 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
NUP88Q99567 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
NUP88Q99567 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
NUP88Q99567 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
NUP88Q99567 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
NUP88Q99567 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
NUP88Q99567 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
NUP88Q99567 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
NUP88Q99567 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
NUP88Q99567 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
NUP88Q99567 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
NUP88Q99567 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
NUP88Q99567 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
NUP88Q99567 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
NUP88Q99567 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
NUP88Q99567 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
NUP88Q99567 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
NUP88Q99567 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
NUP88Q99567 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC21.07■□□□□ 0.96
NUP88Q99567 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
NUP88Q99567 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
NUP88Q99567 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
NUP88Q99567 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
NUP88Q99567 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
NUP88Q99567 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms