Protein–RNA interactions for Protein: Q96RJ3

TNFRSF13C, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 13C, humanhuman

Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFRSF13CQ96RJ3 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TNFRSF13CQ96RJ3 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TNFRSF13CQ96RJ3 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TNFRSF13CQ96RJ3 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TNFRSF13CQ96RJ3 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TNFRSF13CQ96RJ3 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TNFRSF13CQ96RJ3 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TNFRSF13CQ96RJ3 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TNFRSF13CQ96RJ3 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TNFRSF13CQ96RJ3 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
TNFRSF13CQ96RJ3 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TNFRSF13CQ96RJ3 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TNFRSF13CQ96RJ3 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TNFRSF13CQ96RJ3 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TNFRSF13CQ96RJ3 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TNFRSF13CQ96RJ3 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
TNFRSF13CQ96RJ3 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TNFRSF13CQ96RJ3 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TNFRSF13CQ96RJ3 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TNFRSF13CQ96RJ3 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TNFRSF13CQ96RJ3 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TNFRSF13CQ96RJ3 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TNFRSF13CQ96RJ3 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TNFRSF13CQ96RJ3 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TNFRSF13CQ96RJ3 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TNFRSF13CQ96RJ3 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TNFRSF13CQ96RJ3 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TNFRSF13CQ96RJ3 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TNFRSF13CQ96RJ3 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TNFRSF13CQ96RJ3 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TNFRSF13CQ96RJ3 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TNFRSF13CQ96RJ3 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TNFRSF13CQ96RJ3 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TNFRSF13CQ96RJ3 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TNFRSF13CQ96RJ3 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TNFRSF13CQ96RJ3 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TNFRSF13CQ96RJ3 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TNFRSF13CQ96RJ3 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TNFRSF13CQ96RJ3 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TNFRSF13CQ96RJ3 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TNFRSF13CQ96RJ3 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TNFRSF13CQ96RJ3 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TNFRSF13CQ96RJ3 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TNFRSF13CQ96RJ3 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TNFRSF13CQ96RJ3 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TNFRSF13CQ96RJ3 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TNFRSF13CQ96RJ3 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TNFRSF13CQ96RJ3 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TNFRSF13CQ96RJ3 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TNFRSF13CQ96RJ3 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TNFRSF13CQ96RJ3 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TNFRSF13CQ96RJ3 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TNFRSF13CQ96RJ3 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TNFRSF13CQ96RJ3 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TNFRSF13CQ96RJ3 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TNFRSF13CQ96RJ3 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TNFRSF13CQ96RJ3 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TNFRSF13CQ96RJ3 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
TNFRSF13CQ96RJ3 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TNFRSF13CQ96RJ3 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TNFRSF13CQ96RJ3 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TNFRSF13CQ96RJ3 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TNFRSF13CQ96RJ3 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TNFRSF13CQ96RJ3 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TNFRSF13CQ96RJ3 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TNFRSF13CQ96RJ3 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TNFRSF13CQ96RJ3 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TNFRSF13CQ96RJ3 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TNFRSF13CQ96RJ3 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TNFRSF13CQ96RJ3 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TNFRSF13CQ96RJ3 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TNFRSF13CQ96RJ3 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TNFRSF13CQ96RJ3 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TNFRSF13CQ96RJ3 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TNFRSF13CQ96RJ3 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TNFRSF13CQ96RJ3 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TNFRSF13CQ96RJ3 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TNFRSF13CQ96RJ3 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TNFRSF13CQ96RJ3 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TNFRSF13CQ96RJ3 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TNFRSF13CQ96RJ3 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TNFRSF13CQ96RJ3 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TNFRSF13CQ96RJ3 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TNFRSF13CQ96RJ3 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TNFRSF13CQ96RJ3 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TNFRSF13CQ96RJ3 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TNFRSF13CQ96RJ3 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TNFRSF13CQ96RJ3 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TNFRSF13CQ96RJ3 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TNFRSF13CQ96RJ3 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TNFRSF13CQ96RJ3 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TNFRSF13CQ96RJ3 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
TNFRSF13CQ96RJ3 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
TNFRSF13CQ96RJ3 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TNFRSF13CQ96RJ3 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TNFRSF13CQ96RJ3 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TNFRSF13CQ96RJ3 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TNFRSF13CQ96RJ3 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TNFRSF13CQ96RJ3 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TNFRSF13CQ96RJ3 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.4 ms