Protein–RNA interactions for Protein: Q96QH2

PRAM1, PML-RARA-regulated adapter molecule 1, humanhuman

Predictions only

Length 718 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAM1Q96QH2 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
PRAM1Q96QH2 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PRAM1Q96QH2 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PRAM1Q96QH2 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PRAM1Q96QH2 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PRAM1Q96QH2 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PRAM1Q96QH2 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PRAM1Q96QH2 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PRAM1Q96QH2 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PRAM1Q96QH2 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
PRAM1Q96QH2 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
PRAM1Q96QH2 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
PRAM1Q96QH2 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PRAM1Q96QH2 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PRAM1Q96QH2 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PRAM1Q96QH2 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PRAM1Q96QH2 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PRAM1Q96QH2 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PRAM1Q96QH2 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
PRAM1Q96QH2 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
PRAM1Q96QH2 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
PRAM1Q96QH2 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC24.95■■□□□ 1.59
PRAM1Q96QH2 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PRAM1Q96QH2 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PRAM1Q96QH2 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PRAM1Q96QH2 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
PRAM1Q96QH2 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PRAM1Q96QH2 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PRAM1Q96QH2 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PRAM1Q96QH2 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PRAM1Q96QH2 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PRAM1Q96QH2 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PRAM1Q96QH2 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PRAM1Q96QH2 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PRAM1Q96QH2 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PRAM1Q96QH2 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
PRAM1Q96QH2 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PRAM1Q96QH2 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PRAM1Q96QH2 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PRAM1Q96QH2 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PRAM1Q96QH2 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PRAM1Q96QH2 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PRAM1Q96QH2 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PRAM1Q96QH2 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PRAM1Q96QH2 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PRAM1Q96QH2 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PRAM1Q96QH2 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PRAM1Q96QH2 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PRAM1Q96QH2 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PRAM1Q96QH2 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PRAM1Q96QH2 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PRAM1Q96QH2 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PRAM1Q96QH2 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PRAM1Q96QH2 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PRAM1Q96QH2 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PRAM1Q96QH2 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PRAM1Q96QH2 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PRAM1Q96QH2 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PRAM1Q96QH2 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PRAM1Q96QH2 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PRAM1Q96QH2 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PRAM1Q96QH2 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PRAM1Q96QH2 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
PRAM1Q96QH2 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PRAM1Q96QH2 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PRAM1Q96QH2 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PRAM1Q96QH2 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PRAM1Q96QH2 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PRAM1Q96QH2 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PRAM1Q96QH2 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PRAM1Q96QH2 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PRAM1Q96QH2 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PRAM1Q96QH2 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PRAM1Q96QH2 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PRAM1Q96QH2 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PRAM1Q96QH2 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PRAM1Q96QH2 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PRAM1Q96QH2 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PRAM1Q96QH2 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PRAM1Q96QH2 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PRAM1Q96QH2 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PRAM1Q96QH2 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PRAM1Q96QH2 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PRAM1Q96QH2 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PRAM1Q96QH2 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PRAM1Q96QH2 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PRAM1Q96QH2 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PRAM1Q96QH2 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PRAM1Q96QH2 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PRAM1Q96QH2 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
PRAM1Q96QH2 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PRAM1Q96QH2 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PRAM1Q96QH2 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PRAM1Q96QH2 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PRAM1Q96QH2 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PRAM1Q96QH2 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PRAM1Q96QH2 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PRAM1Q96QH2 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PRAM1Q96QH2 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PRAM1Q96QH2 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms