Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q05

TRAPPC9, Trafficking protein particle complex subunit 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC9Q96Q05 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
TRAPPC9Q96Q05 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
TRAPPC9Q96Q05 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
TRAPPC9Q96Q05 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
TRAPPC9Q96Q05 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
TRAPPC9Q96Q05 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRAPPC9Q96Q05 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRAPPC9Q96Q05 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRAPPC9Q96Q05 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRAPPC9Q96Q05 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRAPPC9Q96Q05 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRAPPC9Q96Q05 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRAPPC9Q96Q05 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRAPPC9Q96Q05 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRAPPC9Q96Q05 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRAPPC9Q96Q05 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRAPPC9Q96Q05 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRAPPC9Q96Q05 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRAPPC9Q96Q05 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRAPPC9Q96Q05 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRAPPC9Q96Q05 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRAPPC9Q96Q05 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRAPPC9Q96Q05 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRAPPC9Q96Q05 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRAPPC9Q96Q05 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRAPPC9Q96Q05 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRAPPC9Q96Q05 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRAPPC9Q96Q05 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRAPPC9Q96Q05 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRAPPC9Q96Q05 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
TRAPPC9Q96Q05 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
TRAPPC9Q96Q05 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRAPPC9Q96Q05 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRAPPC9Q96Q05 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRAPPC9Q96Q05 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRAPPC9Q96Q05 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRAPPC9Q96Q05 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRAPPC9Q96Q05 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
TRAPPC9Q96Q05 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
TRAPPC9Q96Q05 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRAPPC9Q96Q05 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
TRAPPC9Q96Q05 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TRAPPC9Q96Q05 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
TRAPPC9Q96Q05 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TRAPPC9Q96Q05 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TRAPPC9Q96Q05 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
TRAPPC9Q96Q05 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TRAPPC9Q96Q05 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC18■□□□□ 0.47
TRAPPC9Q96Q05 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
TRAPPC9Q96Q05 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
TRAPPC9Q96Q05 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
TRAPPC9Q96Q05 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC18■□□□□ 0.47
TRAPPC9Q96Q05 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
TRAPPC9Q96Q05 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
TRAPPC9Q96Q05 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
TRAPPC9Q96Q05 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TRAPPC9Q96Q05 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TRAPPC9Q96Q05 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TRAPPC9Q96Q05 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
TRAPPC9Q96Q05 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TRAPPC9Q96Q05 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
TRAPPC9Q96Q05 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TRAPPC9Q96Q05 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TRAPPC9Q96Q05 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TRAPPC9Q96Q05 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TRAPPC9Q96Q05 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRAPPC9Q96Q05 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRAPPC9Q96Q05 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRAPPC9Q96Q05 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRAPPC9Q96Q05 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRAPPC9Q96Q05 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRAPPC9Q96Q05 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRAPPC9Q96Q05 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRAPPC9Q96Q05 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRAPPC9Q96Q05 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRAPPC9Q96Q05 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRAPPC9Q96Q05 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRAPPC9Q96Q05 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRAPPC9Q96Q05 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRAPPC9Q96Q05 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRAPPC9Q96Q05 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRAPPC9Q96Q05 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRAPPC9Q96Q05 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRAPPC9Q96Q05 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRAPPC9Q96Q05 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRAPPC9Q96Q05 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
TRAPPC9Q96Q05 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRAPPC9Q96Q05 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRAPPC9Q96Q05 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRAPPC9Q96Q05 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRAPPC9Q96Q05 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRAPPC9Q96Q05 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
TRAPPC9Q96Q05 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRAPPC9Q96Q05 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRAPPC9Q96Q05 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRAPPC9Q96Q05 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRAPPC9Q96Q05 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRAPPC9Q96Q05 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRAPPC9Q96Q05 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRAPPC9Q96Q05 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.9 ms