Protein–RNA interactions for Protein: Q96P69

GPR78, G-protein coupled receptor 78, humanhuman

Predictions only

Length 363 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPR78Q96P69 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
GPR78Q96P69 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GPR78Q96P69 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
GPR78Q96P69 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GPR78Q96P69 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
GPR78Q96P69 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
GPR78Q96P69 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GPR78Q96P69 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
GPR78Q96P69 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GPR78Q96P69 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GPR78Q96P69 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
GPR78Q96P69 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
GPR78Q96P69 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
GPR78Q96P69 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
GPR78Q96P69 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
GPR78Q96P69 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
GPR78Q96P69 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
GPR78Q96P69 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
GPR78Q96P69 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
GPR78Q96P69 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
GPR78Q96P69 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GPR78Q96P69 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GPR78Q96P69 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GPR78Q96P69 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
GPR78Q96P69 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
GPR78Q96P69 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
GPR78Q96P69 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
GPR78Q96P69 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
GPR78Q96P69 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GPR78Q96P69 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GPR78Q96P69 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GPR78Q96P69 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
GPR78Q96P69 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GPR78Q96P69 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
GPR78Q96P69 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GPR78Q96P69 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GPR78Q96P69 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
GPR78Q96P69 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GPR78Q96P69 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
GPR78Q96P69 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
GPR78Q96P69 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
GPR78Q96P69 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
GPR78Q96P69 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
GPR78Q96P69 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GPR78Q96P69 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
GPR78Q96P69 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
GPR78Q96P69 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GPR78Q96P69 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
GPR78Q96P69 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GPR78Q96P69 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
GPR78Q96P69 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
GPR78Q96P69 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
GPR78Q96P69 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
GPR78Q96P69 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
GPR78Q96P69 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
GPR78Q96P69 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
GPR78Q96P69 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
GPR78Q96P69 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
GPR78Q96P69 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
GPR78Q96P69 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
GPR78Q96P69 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
GPR78Q96P69 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
GPR78Q96P69 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
GPR78Q96P69 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
GPR78Q96P69 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
GPR78Q96P69 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
GPR78Q96P69 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
GPR78Q96P69 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
GPR78Q96P69 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
GPR78Q96P69 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
GPR78Q96P69 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
GPR78Q96P69 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
GPR78Q96P69 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
GPR78Q96P69 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
GPR78Q96P69 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
GPR78Q96P69 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
GPR78Q96P69 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
GPR78Q96P69 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
GPR78Q96P69 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
GPR78Q96P69 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GPR78Q96P69 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GPR78Q96P69 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
GPR78Q96P69 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GPR78Q96P69 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GPR78Q96P69 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GPR78Q96P69 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
GPR78Q96P69 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GPR78Q96P69 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GPR78Q96P69 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
GPR78Q96P69 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GPR78Q96P69 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GPR78Q96P69 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GPR78Q96P69 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GPR78Q96P69 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GPR78Q96P69 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
GPR78Q96P69 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GPR78Q96P69 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
GPR78Q96P69 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GPR78Q96P69 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
GPR78Q96P69 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms