Protein–RNA interactions for Protein: Q96P20

NLRP3, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,036 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLRP3Q96P20 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NLRP3Q96P20 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
NLRP3Q96P20 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NLRP3Q96P20 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NLRP3Q96P20 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NLRP3Q96P20 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NLRP3Q96P20 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NLRP3Q96P20 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NLRP3Q96P20 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NLRP3Q96P20 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NLRP3Q96P20 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NLRP3Q96P20 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NLRP3Q96P20 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NLRP3Q96P20 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NLRP3Q96P20 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NLRP3Q96P20 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NLRP3Q96P20 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NLRP3Q96P20 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NLRP3Q96P20 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NLRP3Q96P20 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NLRP3Q96P20 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NLRP3Q96P20 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NLRP3Q96P20 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NLRP3Q96P20 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NLRP3Q96P20 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NLRP3Q96P20 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NLRP3Q96P20 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NLRP3Q96P20 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
NLRP3Q96P20 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NLRP3Q96P20 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NLRP3Q96P20 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NLRP3Q96P20 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
NLRP3Q96P20 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NLRP3Q96P20 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NLRP3Q96P20 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NLRP3Q96P20 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NLRP3Q96P20 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NLRP3Q96P20 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NLRP3Q96P20 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NLRP3Q96P20 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NLRP3Q96P20 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NLRP3Q96P20 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NLRP3Q96P20 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NLRP3Q96P20 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NLRP3Q96P20 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
NLRP3Q96P20 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NLRP3Q96P20 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NLRP3Q96P20 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NLRP3Q96P20 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NLRP3Q96P20 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NLRP3Q96P20 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NLRP3Q96P20 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NLRP3Q96P20 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NLRP3Q96P20 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NLRP3Q96P20 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NLRP3Q96P20 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NLRP3Q96P20 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NLRP3Q96P20 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NLRP3Q96P20 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NLRP3Q96P20 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NLRP3Q96P20 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NLRP3Q96P20 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NLRP3Q96P20 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NLRP3Q96P20 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NLRP3Q96P20 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NLRP3Q96P20 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NLRP3Q96P20 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NLRP3Q96P20 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NLRP3Q96P20 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NLRP3Q96P20 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NLRP3Q96P20 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
NLRP3Q96P20 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NLRP3Q96P20 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NLRP3Q96P20 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NLRP3Q96P20 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NLRP3Q96P20 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NLRP3Q96P20 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NLRP3Q96P20 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
NLRP3Q96P20 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NLRP3Q96P20 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NLRP3Q96P20 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NLRP3Q96P20 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NLRP3Q96P20 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
NLRP3Q96P20 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
NLRP3Q96P20 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NLRP3Q96P20 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NLRP3Q96P20 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NLRP3Q96P20 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NLRP3Q96P20 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NLRP3Q96P20 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NLRP3Q96P20 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NLRP3Q96P20 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NLRP3Q96P20 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NLRP3Q96P20 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NLRP3Q96P20 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NLRP3Q96P20 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NLRP3Q96P20 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NLRP3Q96P20 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NLRP3Q96P20 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NLRP3Q96P20 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36 ms