Protein–RNA interactions for Protein: Q96MG2

JSRP1, Junctional sarcoplasmic reticulum protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
JSRP1Q96MG2 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
JSRP1Q96MG2 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
JSRP1Q96MG2 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
JSRP1Q96MG2 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
JSRP1Q96MG2 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
JSRP1Q96MG2 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
JSRP1Q96MG2 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
JSRP1Q96MG2 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
JSRP1Q96MG2 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
JSRP1Q96MG2 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
JSRP1Q96MG2 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
JSRP1Q96MG2 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
JSRP1Q96MG2 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
JSRP1Q96MG2 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
JSRP1Q96MG2 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC16.6■□□□□ 0.25
JSRP1Q96MG2 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC16.6■□□□□ 0.25
JSRP1Q96MG2 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
JSRP1Q96MG2 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
JSRP1Q96MG2 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
JSRP1Q96MG2 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
JSRP1Q96MG2 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
JSRP1Q96MG2 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
JSRP1Q96MG2 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
JSRP1Q96MG2 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
JSRP1Q96MG2 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
JSRP1Q96MG2 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
JSRP1Q96MG2 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
JSRP1Q96MG2 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
JSRP1Q96MG2 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
JSRP1Q96MG2 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
JSRP1Q96MG2 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
JSRP1Q96MG2 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
JSRP1Q96MG2 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
JSRP1Q96MG2 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
JSRP1Q96MG2 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
JSRP1Q96MG2 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
JSRP1Q96MG2 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
JSRP1Q96MG2 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
JSRP1Q96MG2 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
JSRP1Q96MG2 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
JSRP1Q96MG2 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
JSRP1Q96MG2 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
JSRP1Q96MG2 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
JSRP1Q96MG2 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
JSRP1Q96MG2 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
JSRP1Q96MG2 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
JSRP1Q96MG2 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
JSRP1Q96MG2 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
JSRP1Q96MG2 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
JSRP1Q96MG2 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
JSRP1Q96MG2 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
JSRP1Q96MG2 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
JSRP1Q96MG2 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
JSRP1Q96MG2 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
JSRP1Q96MG2 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
JSRP1Q96MG2 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
JSRP1Q96MG2 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
JSRP1Q96MG2 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
JSRP1Q96MG2 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
JSRP1Q96MG2 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
JSRP1Q96MG2 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
JSRP1Q96MG2 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
JSRP1Q96MG2 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
JSRP1Q96MG2 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
JSRP1Q96MG2 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
JSRP1Q96MG2 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
JSRP1Q96MG2 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
JSRP1Q96MG2 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
JSRP1Q96MG2 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
JSRP1Q96MG2 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
JSRP1Q96MG2 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
JSRP1Q96MG2 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
JSRP1Q96MG2 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
JSRP1Q96MG2 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
JSRP1Q96MG2 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
JSRP1Q96MG2 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
JSRP1Q96MG2 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
JSRP1Q96MG2 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
JSRP1Q96MG2 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
JSRP1Q96MG2 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
JSRP1Q96MG2 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
JSRP1Q96MG2 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
JSRP1Q96MG2 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
JSRP1Q96MG2 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
JSRP1Q96MG2 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
JSRP1Q96MG2 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
JSRP1Q96MG2 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
JSRP1Q96MG2 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
JSRP1Q96MG2 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
JSRP1Q96MG2 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
JSRP1Q96MG2 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
JSRP1Q96MG2 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
JSRP1Q96MG2 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
JSRP1Q96MG2 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
JSRP1Q96MG2 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
JSRP1Q96MG2 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
JSRP1Q96MG2 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
JSRP1Q96MG2 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
JSRP1Q96MG2 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
JSRP1Q96MG2 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms