Protein–RNA interactions for Protein: Q96MD7

C9orf85, Uncharacterized protein C9orf85, humanhuman

Predictions only

Length 179 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf85Q96MD7 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
C9orf85Q96MD7 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
C9orf85Q96MD7 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
C9orf85Q96MD7 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
C9orf85Q96MD7 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
C9orf85Q96MD7 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
C9orf85Q96MD7 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
C9orf85Q96MD7 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC13.1□□□□□ -0.31
C9orf85Q96MD7 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
C9orf85Q96MD7 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
C9orf85Q96MD7 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
C9orf85Q96MD7 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
C9orf85Q96MD7 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
C9orf85Q96MD7 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
C9orf85Q96MD7 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
C9orf85Q96MD7 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
C9orf85Q96MD7 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
C9orf85Q96MD7 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
C9orf85Q96MD7 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
C9orf85Q96MD7 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
C9orf85Q96MD7 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
C9orf85Q96MD7 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
C9orf85Q96MD7 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
C9orf85Q96MD7 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
C9orf85Q96MD7 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
C9orf85Q96MD7 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
C9orf85Q96MD7 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
C9orf85Q96MD7 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
C9orf85Q96MD7 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
C9orf85Q96MD7 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
C9orf85Q96MD7 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
C9orf85Q96MD7 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
C9orf85Q96MD7 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
C9orf85Q96MD7 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
C9orf85Q96MD7 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
C9orf85Q96MD7 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
C9orf85Q96MD7 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
C9orf85Q96MD7 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
C9orf85Q96MD7 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
C9orf85Q96MD7 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
C9orf85Q96MD7 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
C9orf85Q96MD7 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
C9orf85Q96MD7 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
C9orf85Q96MD7 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
C9orf85Q96MD7 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
C9orf85Q96MD7 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
C9orf85Q96MD7 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
C9orf85Q96MD7 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
C9orf85Q96MD7 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
C9orf85Q96MD7 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
C9orf85Q96MD7 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
C9orf85Q96MD7 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
C9orf85Q96MD7 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
C9orf85Q96MD7 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
C9orf85Q96MD7 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
C9orf85Q96MD7 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
C9orf85Q96MD7 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
C9orf85Q96MD7 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
C9orf85Q96MD7 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
C9orf85Q96MD7 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
C9orf85Q96MD7 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
C9orf85Q96MD7 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
C9orf85Q96MD7 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
C9orf85Q96MD7 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
C9orf85Q96MD7 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
C9orf85Q96MD7 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
C9orf85Q96MD7 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
C9orf85Q96MD7 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
C9orf85Q96MD7 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
C9orf85Q96MD7 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
C9orf85Q96MD7 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
C9orf85Q96MD7 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
C9orf85Q96MD7 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
C9orf85Q96MD7 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
C9orf85Q96MD7 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
C9orf85Q96MD7 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
C9orf85Q96MD7 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
C9orf85Q96MD7 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
C9orf85Q96MD7 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
C9orf85Q96MD7 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
C9orf85Q96MD7 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
C9orf85Q96MD7 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
C9orf85Q96MD7 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
C9orf85Q96MD7 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
C9orf85Q96MD7 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
C9orf85Q96MD7 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
C9orf85Q96MD7 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
C9orf85Q96MD7 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
C9orf85Q96MD7 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
C9orf85Q96MD7 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
C9orf85Q96MD7 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
C9orf85Q96MD7 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
C9orf85Q96MD7 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
C9orf85Q96MD7 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
C9orf85Q96MD7 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
C9orf85Q96MD7 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
C9orf85Q96MD7 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
C9orf85Q96MD7 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
C9orf85Q96MD7 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
C9orf85Q96MD7 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.7 ms