Protein–RNA interactions for Protein: Q96M96

FGD4, FYVE, RhoGEF and PH domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 766 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGD4Q96M96 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
FGD4Q96M96 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
FGD4Q96M96 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
FGD4Q96M96 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
FGD4Q96M96 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
FGD4Q96M96 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC20.39■□□□□ 0.85
FGD4Q96M96 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
FGD4Q96M96 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC20.39■□□□□ 0.85
FGD4Q96M96 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
FGD4Q96M96 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
FGD4Q96M96 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
FGD4Q96M96 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
FGD4Q96M96 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
FGD4Q96M96 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
FGD4Q96M96 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
FGD4Q96M96 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
FGD4Q96M96 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
FGD4Q96M96 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
FGD4Q96M96 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
FGD4Q96M96 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
FGD4Q96M96 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
FGD4Q96M96 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
FGD4Q96M96 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
FGD4Q96M96 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
FGD4Q96M96 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
FGD4Q96M96 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
FGD4Q96M96 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
FGD4Q96M96 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
FGD4Q96M96 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
FGD4Q96M96 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
FGD4Q96M96 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
FGD4Q96M96 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
FGD4Q96M96 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
FGD4Q96M96 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
FGD4Q96M96 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
FGD4Q96M96 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
FGD4Q96M96 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC20.38■□□□□ 0.85
FGD4Q96M96 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
FGD4Q96M96 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
FGD4Q96M96 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
FGD4Q96M96 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
FGD4Q96M96 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
FGD4Q96M96 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
FGD4Q96M96 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
FGD4Q96M96 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
FGD4Q96M96 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
FGD4Q96M96 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
FGD4Q96M96 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
FGD4Q96M96 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
FGD4Q96M96 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
FGD4Q96M96 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
FGD4Q96M96 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
FGD4Q96M96 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
FGD4Q96M96 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
FGD4Q96M96 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
FGD4Q96M96 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
FGD4Q96M96 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
FGD4Q96M96 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
FGD4Q96M96 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
FGD4Q96M96 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
FGD4Q96M96 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
FGD4Q96M96 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
FGD4Q96M96 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
FGD4Q96M96 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
FGD4Q96M96 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC20.37■□□□□ 0.85
FGD4Q96M96 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
FGD4Q96M96 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
FGD4Q96M96 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
FGD4Q96M96 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
FGD4Q96M96 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
FGD4Q96M96 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
FGD4Q96M96 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
FGD4Q96M96 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
FGD4Q96M96 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
FGD4Q96M96 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
FGD4Q96M96 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
FGD4Q96M96 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
FGD4Q96M96 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
FGD4Q96M96 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
FGD4Q96M96 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
FGD4Q96M96 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
FGD4Q96M96 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
FGD4Q96M96 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
FGD4Q96M96 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
FGD4Q96M96 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
FGD4Q96M96 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
FGD4Q96M96 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
FGD4Q96M96 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
FGD4Q96M96 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
FGD4Q96M96 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
FGD4Q96M96 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
FGD4Q96M96 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
FGD4Q96M96 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
FGD4Q96M96 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
FGD4Q96M96 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
FGD4Q96M96 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
FGD4Q96M96 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
FGD4Q96M96 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
FGD4Q96M96 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
FGD4Q96M96 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 107.3 ms