Protein–RNA interactions for Protein: Q96LD1

SGCZ, Zeta-sarcoglycan, humanhuman

Predictions only

Length 299 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCZQ96LD1 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
SGCZQ96LD1 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SGCZQ96LD1 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SGCZQ96LD1 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SGCZQ96LD1 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SGCZQ96LD1 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SGCZQ96LD1 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SGCZQ96LD1 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SGCZQ96LD1 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SGCZQ96LD1 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SGCZQ96LD1 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
SGCZQ96LD1 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SGCZQ96LD1 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
SGCZQ96LD1 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SGCZQ96LD1 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
SGCZQ96LD1 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
SGCZQ96LD1 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SGCZQ96LD1 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SGCZQ96LD1 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SGCZQ96LD1 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SGCZQ96LD1 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
SGCZQ96LD1 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SGCZQ96LD1 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SGCZQ96LD1 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SGCZQ96LD1 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SGCZQ96LD1 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SGCZQ96LD1 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SGCZQ96LD1 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SGCZQ96LD1 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SGCZQ96LD1 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SGCZQ96LD1 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SGCZQ96LD1 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SGCZQ96LD1 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SGCZQ96LD1 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SGCZQ96LD1 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SGCZQ96LD1 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SGCZQ96LD1 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
SGCZQ96LD1 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SGCZQ96LD1 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SGCZQ96LD1 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SGCZQ96LD1 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SGCZQ96LD1 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SGCZQ96LD1 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SGCZQ96LD1 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SGCZQ96LD1 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SGCZQ96LD1 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SGCZQ96LD1 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SGCZQ96LD1 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SGCZQ96LD1 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
SGCZQ96LD1 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
SGCZQ96LD1 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SGCZQ96LD1 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SGCZQ96LD1 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SGCZQ96LD1 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SGCZQ96LD1 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
SGCZQ96LD1 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SGCZQ96LD1 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SGCZQ96LD1 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SGCZQ96LD1 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SGCZQ96LD1 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SGCZQ96LD1 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SGCZQ96LD1 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SGCZQ96LD1 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SGCZQ96LD1 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SGCZQ96LD1 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SGCZQ96LD1 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SGCZQ96LD1 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SGCZQ96LD1 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SGCZQ96LD1 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SGCZQ96LD1 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SGCZQ96LD1 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SGCZQ96LD1 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SGCZQ96LD1 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SGCZQ96LD1 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SGCZQ96LD1 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SGCZQ96LD1 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SGCZQ96LD1 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SGCZQ96LD1 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SGCZQ96LD1 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SGCZQ96LD1 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SGCZQ96LD1 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SGCZQ96LD1 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SGCZQ96LD1 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SGCZQ96LD1 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SGCZQ96LD1 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SGCZQ96LD1 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SGCZQ96LD1 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SGCZQ96LD1 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SGCZQ96LD1 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SGCZQ96LD1 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SGCZQ96LD1 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SGCZQ96LD1 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SGCZQ96LD1 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SGCZQ96LD1 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SGCZQ96LD1 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SGCZQ96LD1 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SGCZQ96LD1 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SGCZQ96LD1 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SGCZQ96LD1 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SGCZQ96LD1 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
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