Protein–RNA interactions for Protein: Q96K30

RITA1, RBPJ-interacting and tubulin-associated protein 1, humanhuman

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Length 269 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RITA1Q96K30 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
RITA1Q96K30 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
RITA1Q96K30 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
RITA1Q96K30 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
RITA1Q96K30 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
RITA1Q96K30 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
RITA1Q96K30 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
RITA1Q96K30 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
RITA1Q96K30 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
RITA1Q96K30 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
RITA1Q96K30 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
RITA1Q96K30 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
RITA1Q96K30 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
RITA1Q96K30 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
RITA1Q96K30 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
RITA1Q96K30 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
RITA1Q96K30 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
RITA1Q96K30 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
RITA1Q96K30 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
RITA1Q96K30 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
RITA1Q96K30 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
RITA1Q96K30 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
RITA1Q96K30 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
RITA1Q96K30 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RITA1Q96K30 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
RITA1Q96K30 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RITA1Q96K30 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RITA1Q96K30 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RITA1Q96K30 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
RITA1Q96K30 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
RITA1Q96K30 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
RITA1Q96K30 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
RITA1Q96K30 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
RITA1Q96K30 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RITA1Q96K30 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
RITA1Q96K30 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
RITA1Q96K30 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RITA1Q96K30 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RITA1Q96K30 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RITA1Q96K30 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RITA1Q96K30 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RITA1Q96K30 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
RITA1Q96K30 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RITA1Q96K30 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
RITA1Q96K30 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC14.5□□□□□ -0.09
RITA1Q96K30 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
RITA1Q96K30 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
RITA1Q96K30 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
RITA1Q96K30 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RITA1Q96K30 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RITA1Q96K30 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RITA1Q96K30 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RITA1Q96K30 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
RITA1Q96K30 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
RITA1Q96K30 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
RITA1Q96K30 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RITA1Q96K30 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
RITA1Q96K30 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RITA1Q96K30 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
RITA1Q96K30 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RITA1Q96K30 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
RITA1Q96K30 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RITA1Q96K30 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RITA1Q96K30 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
RITA1Q96K30 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RITA1Q96K30 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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RITA1Q96K30 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RITA1Q96K30 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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RITA1Q96K30 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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RITA1Q96K30 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RITA1Q96K30 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
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RITA1Q96K30 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
RITA1Q96K30 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
RITA1Q96K30 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
RITA1Q96K30 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
RITA1Q96K30 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
RITA1Q96K30 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RITA1Q96K30 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RITA1Q96K30 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RITA1Q96K30 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RITA1Q96K30 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
RITA1Q96K30 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RITA1Q96K30 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RITA1Q96K30 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RITA1Q96K30 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
RITA1Q96K30 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RITA1Q96K30 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
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