Protein–RNA interactions for Protein: Q96JQ0

DCHS1, Protocadherin-16, humanhuman

Predictions only

Length 3,298 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCHS1Q96JQ0 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
DCHS1Q96JQ0 STMN1-204ENST00000426559 948 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
DCHS1Q96JQ0 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
DCHS1Q96JQ0 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
DCHS1Q96JQ0 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
DCHS1Q96JQ0 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
DCHS1Q96JQ0 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
DCHS1Q96JQ0 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
DCHS1Q96JQ0 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
DCHS1Q96JQ0 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
DCHS1Q96JQ0 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
DCHS1Q96JQ0 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
DCHS1Q96JQ0 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
DCHS1Q96JQ0 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
DCHS1Q96JQ0 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
DCHS1Q96JQ0 HIST1H2AD-201ENST00000341023 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
DCHS1Q96JQ0 LINC01818-201ENST00000437118 368 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
DCHS1Q96JQ0 PSEN2-206ENST00000472139 1163 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
DCHS1Q96JQ0 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
DCHS1Q96JQ0 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
DCHS1Q96JQ0 MIR6787-201ENST00000616675 61 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
DCHS1Q96JQ0 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
DCHS1Q96JQ0 AL390754.1-201ENST00000619088 582 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
DCHS1Q96JQ0 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
DCHS1Q96JQ0 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
DCHS1Q96JQ0 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
DCHS1Q96JQ0 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
DCHS1Q96JQ0 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
DCHS1Q96JQ0 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
DCHS1Q96JQ0 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
DCHS1Q96JQ0 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
DCHS1Q96JQ0 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
DCHS1Q96JQ0 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
DCHS1Q96JQ0 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
DCHS1Q96JQ0 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
DCHS1Q96JQ0 BCYRN1-201ENST00000418539 200 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
DCHS1Q96JQ0 NUTM2A-AS1-212ENST00000458739 733 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
DCHS1Q96JQ0 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
DCHS1Q96JQ0 AC046168.2-201ENST00000560590 875 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
DCHS1Q96JQ0 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
DCHS1Q96JQ0 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
DCHS1Q96JQ0 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
DCHS1Q96JQ0 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
DCHS1Q96JQ0 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
DCHS1Q96JQ0 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
DCHS1Q96JQ0 POLR2I-201ENST00000221859 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
DCHS1Q96JQ0 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
DCHS1Q96JQ0 AL356489.1-201ENST00000449144 1144 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
DCHS1Q96JQ0 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC17.12■□□□□ 0.33
DCHS1Q96JQ0 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
DCHS1Q96JQ0 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
DCHS1Q96JQ0 TEKT2-201ENST00000207457 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
DCHS1Q96JQ0 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
DCHS1Q96JQ0 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
DCHS1Q96JQ0 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
DCHS1Q96JQ0 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
DCHS1Q96JQ0 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
DCHS1Q96JQ0 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
DCHS1Q96JQ0 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
DCHS1Q96JQ0 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
DCHS1Q96JQ0 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
DCHS1Q96JQ0 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
DCHS1Q96JQ0 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
DCHS1Q96JQ0 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
DCHS1Q96JQ0 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
DCHS1Q96JQ0 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
DCHS1Q96JQ0 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
DCHS1Q96JQ0 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
DCHS1Q96JQ0 FAM212B-207ENST00000534365 1217 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
DCHS1Q96JQ0 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
DCHS1Q96JQ0 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
DCHS1Q96JQ0 AC010336.6-201ENST00000595107 528 ntTSL 4 BASIC17.11■□□□□ 0.33
DCHS1Q96JQ0 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
DCHS1Q96JQ0 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
DCHS1Q96JQ0 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
DCHS1Q96JQ0 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
DCHS1Q96JQ0 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
DCHS1Q96JQ0 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
DCHS1Q96JQ0 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
DCHS1Q96JQ0 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
DCHS1Q96JQ0 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
DCHS1Q96JQ0 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
DCHS1Q96JQ0 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
DCHS1Q96JQ0 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
DCHS1Q96JQ0 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
DCHS1Q96JQ0 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
DCHS1Q96JQ0 KRTAP6-3-201ENST00000391624 636 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
DCHS1Q96JQ0 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
DCHS1Q96JQ0 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
DCHS1Q96JQ0 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
DCHS1Q96JQ0 AC016727.1-204ENST00000578974 420 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
DCHS1Q96JQ0 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
DCHS1Q96JQ0 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
DCHS1Q96JQ0 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
DCHS1Q96JQ0 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
DCHS1Q96JQ0 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
DCHS1Q96JQ0 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
DCHS1Q96JQ0 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
DCHS1Q96JQ0 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
DCHS1Q96JQ0 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms