Protein–RNA interactions for Protein: Q96JA1

LRIG1, Leucine-rich repeats and immunoglobulin-like domains protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,093 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRIG1Q96JA1 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
LRIG1Q96JA1 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
LRIG1Q96JA1 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
LRIG1Q96JA1 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
LRIG1Q96JA1 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
LRIG1Q96JA1 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
LRIG1Q96JA1 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
LRIG1Q96JA1 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
LRIG1Q96JA1 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
LRIG1Q96JA1 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
LRIG1Q96JA1 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
LRIG1Q96JA1 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
LRIG1Q96JA1 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
LRIG1Q96JA1 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
LRIG1Q96JA1 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
LRIG1Q96JA1 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
LRIG1Q96JA1 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
LRIG1Q96JA1 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC18.06■□□□□ 0.48
LRIG1Q96JA1 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
LRIG1Q96JA1 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
LRIG1Q96JA1 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
LRIG1Q96JA1 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
LRIG1Q96JA1 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
LRIG1Q96JA1 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
LRIG1Q96JA1 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
LRIG1Q96JA1 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
LRIG1Q96JA1 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
LRIG1Q96JA1 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
LRIG1Q96JA1 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
LRIG1Q96JA1 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
LRIG1Q96JA1 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
LRIG1Q96JA1 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
LRIG1Q96JA1 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
LRIG1Q96JA1 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
LRIG1Q96JA1 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
LRIG1Q96JA1 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
LRIG1Q96JA1 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
LRIG1Q96JA1 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
LRIG1Q96JA1 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
LRIG1Q96JA1 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
LRIG1Q96JA1 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
LRIG1Q96JA1 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
LRIG1Q96JA1 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
LRIG1Q96JA1 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
LRIG1Q96JA1 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
LRIG1Q96JA1 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
LRIG1Q96JA1 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
LRIG1Q96JA1 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
LRIG1Q96JA1 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
LRIG1Q96JA1 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
LRIG1Q96JA1 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
LRIG1Q96JA1 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
LRIG1Q96JA1 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC18.05■□□□□ 0.48
LRIG1Q96JA1 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
LRIG1Q96JA1 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
LRIG1Q96JA1 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
LRIG1Q96JA1 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
LRIG1Q96JA1 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
LRIG1Q96JA1 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
LRIG1Q96JA1 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
LRIG1Q96JA1 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
LRIG1Q96JA1 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
LRIG1Q96JA1 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
LRIG1Q96JA1 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
LRIG1Q96JA1 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
LRIG1Q96JA1 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
LRIG1Q96JA1 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
LRIG1Q96JA1 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
LRIG1Q96JA1 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
LRIG1Q96JA1 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
LRIG1Q96JA1 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
LRIG1Q96JA1 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
LRIG1Q96JA1 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
LRIG1Q96JA1 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
LRIG1Q96JA1 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
LRIG1Q96JA1 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
LRIG1Q96JA1 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
LRIG1Q96JA1 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
LRIG1Q96JA1 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
LRIG1Q96JA1 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
LRIG1Q96JA1 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
LRIG1Q96JA1 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
LRIG1Q96JA1 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
LRIG1Q96JA1 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
LRIG1Q96JA1 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
LRIG1Q96JA1 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
LRIG1Q96JA1 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
LRIG1Q96JA1 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC18.04■□□□□ 0.48
LRIG1Q96JA1 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
LRIG1Q96JA1 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
LRIG1Q96JA1 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
LRIG1Q96JA1 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
LRIG1Q96JA1 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
LRIG1Q96JA1 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
LRIG1Q96JA1 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
LRIG1Q96JA1 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
LRIG1Q96JA1 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
LRIG1Q96JA1 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
LRIG1Q96JA1 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
LRIG1Q96JA1 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms