Protein–RNA interactions for Protein: Q96GD3

SCMH1, Polycomb protein SCMH1, humanhuman

Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCMH1Q96GD3 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SCMH1Q96GD3 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SCMH1Q96GD3 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SCMH1Q96GD3 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SCMH1Q96GD3 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
SCMH1Q96GD3 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SCMH1Q96GD3 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SCMH1Q96GD3 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SCMH1Q96GD3 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SCMH1Q96GD3 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SCMH1Q96GD3 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SCMH1Q96GD3 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SCMH1Q96GD3 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SCMH1Q96GD3 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SCMH1Q96GD3 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SCMH1Q96GD3 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SCMH1Q96GD3 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SCMH1Q96GD3 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SCMH1Q96GD3 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
SCMH1Q96GD3 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SCMH1Q96GD3 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SCMH1Q96GD3 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SCMH1Q96GD3 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
SCMH1Q96GD3 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
SCMH1Q96GD3 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
SCMH1Q96GD3 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SCMH1Q96GD3 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SCMH1Q96GD3 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SCMH1Q96GD3 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SCMH1Q96GD3 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SCMH1Q96GD3 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
SCMH1Q96GD3 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SCMH1Q96GD3 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SCMH1Q96GD3 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SCMH1Q96GD3 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SCMH1Q96GD3 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SCMH1Q96GD3 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SCMH1Q96GD3 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SCMH1Q96GD3 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SCMH1Q96GD3 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SCMH1Q96GD3 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SCMH1Q96GD3 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SCMH1Q96GD3 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SCMH1Q96GD3 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SCMH1Q96GD3 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
SCMH1Q96GD3 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SCMH1Q96GD3 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
SCMH1Q96GD3 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SCMH1Q96GD3 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
SCMH1Q96GD3 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SCMH1Q96GD3 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SCMH1Q96GD3 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SCMH1Q96GD3 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SCMH1Q96GD3 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SCMH1Q96GD3 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
SCMH1Q96GD3 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SCMH1Q96GD3 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
SCMH1Q96GD3 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SCMH1Q96GD3 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
SCMH1Q96GD3 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SCMH1Q96GD3 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SCMH1Q96GD3 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SCMH1Q96GD3 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SCMH1Q96GD3 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
SCMH1Q96GD3 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SCMH1Q96GD3 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
SCMH1Q96GD3 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SCMH1Q96GD3 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SCMH1Q96GD3 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SCMH1Q96GD3 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SCMH1Q96GD3 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SCMH1Q96GD3 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SCMH1Q96GD3 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SCMH1Q96GD3 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SCMH1Q96GD3 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SCMH1Q96GD3 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SCMH1Q96GD3 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SCMH1Q96GD3 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SCMH1Q96GD3 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SCMH1Q96GD3 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SCMH1Q96GD3 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SCMH1Q96GD3 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SCMH1Q96GD3 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SCMH1Q96GD3 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SCMH1Q96GD3 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SCMH1Q96GD3 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SCMH1Q96GD3 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SCMH1Q96GD3 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
SCMH1Q96GD3 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SCMH1Q96GD3 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
SCMH1Q96GD3 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SCMH1Q96GD3 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SCMH1Q96GD3 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SCMH1Q96GD3 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
SCMH1Q96GD3 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SCMH1Q96GD3 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
SCMH1Q96GD3 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SCMH1Q96GD3 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SCMH1Q96GD3 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SCMH1Q96GD3 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms