Protein–RNA interactions for Protein: Q96FC9

DDX11, ATP-dependent DNA helicase DDX11, humanhuman

Predictions only

Length 970 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX11Q96FC9 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
DDX11Q96FC9 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
DDX11Q96FC9 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
DDX11Q96FC9 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
DDX11Q96FC9 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
DDX11Q96FC9 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
DDX11Q96FC9 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
DDX11Q96FC9 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
DDX11Q96FC9 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
DDX11Q96FC9 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
DDX11Q96FC9 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
DDX11Q96FC9 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
DDX11Q96FC9 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
DDX11Q96FC9 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
DDX11Q96FC9 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
DDX11Q96FC9 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
DDX11Q96FC9 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
DDX11Q96FC9 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
DDX11Q96FC9 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
DDX11Q96FC9 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
DDX11Q96FC9 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
DDX11Q96FC9 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
DDX11Q96FC9 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
DDX11Q96FC9 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
DDX11Q96FC9 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
DDX11Q96FC9 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
DDX11Q96FC9 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
DDX11Q96FC9 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
DDX11Q96FC9 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
DDX11Q96FC9 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
DDX11Q96FC9 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
DDX11Q96FC9 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
DDX11Q96FC9 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
DDX11Q96FC9 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
DDX11Q96FC9 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
DDX11Q96FC9 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
DDX11Q96FC9 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
DDX11Q96FC9 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
DDX11Q96FC9 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
DDX11Q96FC9 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
DDX11Q96FC9 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
DDX11Q96FC9 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
DDX11Q96FC9 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
DDX11Q96FC9 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
DDX11Q96FC9 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
DDX11Q96FC9 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
DDX11Q96FC9 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
DDX11Q96FC9 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
DDX11Q96FC9 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
DDX11Q96FC9 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
DDX11Q96FC9 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
DDX11Q96FC9 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
DDX11Q96FC9 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
DDX11Q96FC9 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
DDX11Q96FC9 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
DDX11Q96FC9 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
DDX11Q96FC9 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
DDX11Q96FC9 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
DDX11Q96FC9 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
DDX11Q96FC9 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
DDX11Q96FC9 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
DDX11Q96FC9 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
DDX11Q96FC9 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
DDX11Q96FC9 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
DDX11Q96FC9 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
DDX11Q96FC9 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
DDX11Q96FC9 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
DDX11Q96FC9 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
DDX11Q96FC9 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
DDX11Q96FC9 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
DDX11Q96FC9 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
DDX11Q96FC9 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
DDX11Q96FC9 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
DDX11Q96FC9 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
DDX11Q96FC9 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
DDX11Q96FC9 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
DDX11Q96FC9 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
DDX11Q96FC9 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
DDX11Q96FC9 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
DDX11Q96FC9 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
DDX11Q96FC9 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
DDX11Q96FC9 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
DDX11Q96FC9 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
DDX11Q96FC9 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC21.42■■□□□ 1.02
DDX11Q96FC9 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
DDX11Q96FC9 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
DDX11Q96FC9 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
DDX11Q96FC9 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
DDX11Q96FC9 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
DDX11Q96FC9 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
DDX11Q96FC9 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
DDX11Q96FC9 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
DDX11Q96FC9 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
DDX11Q96FC9 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
DDX11Q96FC9 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
DDX11Q96FC9 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
DDX11Q96FC9 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
DDX11Q96FC9 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
DDX11Q96FC9 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
DDX11Q96FC9 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.3 ms