Protein–RNA interactions for Protein: Q96EB6

SIRT1, NAD-dependent protein deacetylase sirtuin-1, humanhuman

Predictions only

Length 747 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIRT1Q96EB6 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SIRT1Q96EB6 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SIRT1Q96EB6 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SIRT1Q96EB6 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SIRT1Q96EB6 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SIRT1Q96EB6 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SIRT1Q96EB6 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SIRT1Q96EB6 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SIRT1Q96EB6 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SIRT1Q96EB6 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SIRT1Q96EB6 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SIRT1Q96EB6 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
SIRT1Q96EB6 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SIRT1Q96EB6 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SIRT1Q96EB6 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SIRT1Q96EB6 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SIRT1Q96EB6 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SIRT1Q96EB6 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SIRT1Q96EB6 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SIRT1Q96EB6 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SIRT1Q96EB6 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SIRT1Q96EB6 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SIRT1Q96EB6 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SIRT1Q96EB6 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SIRT1Q96EB6 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SIRT1Q96EB6 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SIRT1Q96EB6 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SIRT1Q96EB6 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SIRT1Q96EB6 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SIRT1Q96EB6 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SIRT1Q96EB6 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SIRT1Q96EB6 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SIRT1Q96EB6 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SIRT1Q96EB6 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SIRT1Q96EB6 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SIRT1Q96EB6 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SIRT1Q96EB6 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SIRT1Q96EB6 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SIRT1Q96EB6 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SIRT1Q96EB6 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
SIRT1Q96EB6 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SIRT1Q96EB6 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SIRT1Q96EB6 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SIRT1Q96EB6 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SIRT1Q96EB6 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SIRT1Q96EB6 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SIRT1Q96EB6 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SIRT1Q96EB6 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SIRT1Q96EB6 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
SIRT1Q96EB6 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SIRT1Q96EB6 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SIRT1Q96EB6 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SIRT1Q96EB6 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SIRT1Q96EB6 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SIRT1Q96EB6 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SIRT1Q96EB6 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
SIRT1Q96EB6 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SIRT1Q96EB6 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SIRT1Q96EB6 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SIRT1Q96EB6 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SIRT1Q96EB6 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SIRT1Q96EB6 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SIRT1Q96EB6 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SIRT1Q96EB6 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SIRT1Q96EB6 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SIRT1Q96EB6 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SIRT1Q96EB6 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SIRT1Q96EB6 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SIRT1Q96EB6 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SIRT1Q96EB6 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SIRT1Q96EB6 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SIRT1Q96EB6 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
SIRT1Q96EB6 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
SIRT1Q96EB6 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SIRT1Q96EB6 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SIRT1Q96EB6 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SIRT1Q96EB6 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SIRT1Q96EB6 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SIRT1Q96EB6 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SIRT1Q96EB6 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SIRT1Q96EB6 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SIRT1Q96EB6 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
SIRT1Q96EB6 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SIRT1Q96EB6 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SIRT1Q96EB6 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SIRT1Q96EB6 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SIRT1Q96EB6 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SIRT1Q96EB6 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SIRT1Q96EB6 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SIRT1Q96EB6 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SIRT1Q96EB6 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SIRT1Q96EB6 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
SIRT1Q96EB6 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SIRT1Q96EB6 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SIRT1Q96EB6 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SIRT1Q96EB6 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SIRT1Q96EB6 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SIRT1Q96EB6 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SIRT1Q96EB6 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SIRT1Q96EB6 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.4 ms