Protein–RNA interactions for Protein: Q96BD6

SPSB1, SPRY domain-containing SOCS box protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPSB1Q96BD6 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SPSB1Q96BD6 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SPSB1Q96BD6 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
SPSB1Q96BD6 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SPSB1Q96BD6 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SPSB1Q96BD6 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SPSB1Q96BD6 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SPSB1Q96BD6 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
SPSB1Q96BD6 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SPSB1Q96BD6 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SPSB1Q96BD6 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SPSB1Q96BD6 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SPSB1Q96BD6 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SPSB1Q96BD6 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SPSB1Q96BD6 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SPSB1Q96BD6 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SPSB1Q96BD6 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SPSB1Q96BD6 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SPSB1Q96BD6 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SPSB1Q96BD6 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SPSB1Q96BD6 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SPSB1Q96BD6 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SPSB1Q96BD6 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SPSB1Q96BD6 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SPSB1Q96BD6 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SPSB1Q96BD6 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SPSB1Q96BD6 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SPSB1Q96BD6 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SPSB1Q96BD6 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SPSB1Q96BD6 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SPSB1Q96BD6 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SPSB1Q96BD6 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SPSB1Q96BD6 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SPSB1Q96BD6 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SPSB1Q96BD6 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SPSB1Q96BD6 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SPSB1Q96BD6 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SPSB1Q96BD6 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SPSB1Q96BD6 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SPSB1Q96BD6 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SPSB1Q96BD6 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SPSB1Q96BD6 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SPSB1Q96BD6 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SPSB1Q96BD6 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SPSB1Q96BD6 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SPSB1Q96BD6 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
SPSB1Q96BD6 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
SPSB1Q96BD6 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SPSB1Q96BD6 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SPSB1Q96BD6 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
SPSB1Q96BD6 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SPSB1Q96BD6 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SPSB1Q96BD6 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SPSB1Q96BD6 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SPSB1Q96BD6 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SPSB1Q96BD6 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SPSB1Q96BD6 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SPSB1Q96BD6 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SPSB1Q96BD6 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SPSB1Q96BD6 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SPSB1Q96BD6 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SPSB1Q96BD6 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SPSB1Q96BD6 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SPSB1Q96BD6 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SPSB1Q96BD6 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SPSB1Q96BD6 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SPSB1Q96BD6 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SPSB1Q96BD6 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SPSB1Q96BD6 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SPSB1Q96BD6 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SPSB1Q96BD6 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SPSB1Q96BD6 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SPSB1Q96BD6 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SPSB1Q96BD6 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SPSB1Q96BD6 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SPSB1Q96BD6 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SPSB1Q96BD6 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SPSB1Q96BD6 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SPSB1Q96BD6 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SPSB1Q96BD6 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SPSB1Q96BD6 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SPSB1Q96BD6 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SPSB1Q96BD6 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SPSB1Q96BD6 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SPSB1Q96BD6 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SPSB1Q96BD6 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SPSB1Q96BD6 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SPSB1Q96BD6 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SPSB1Q96BD6 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SPSB1Q96BD6 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SPSB1Q96BD6 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SPSB1Q96BD6 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SPSB1Q96BD6 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SPSB1Q96BD6 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SPSB1Q96BD6 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SPSB1Q96BD6 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SPSB1Q96BD6 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SPSB1Q96BD6 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SPSB1Q96BD6 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SPSB1Q96BD6 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.2 ms