Protein–RNA interactions for Protein: Q969T3

SNX21, Sorting nexin-21, humanhuman

Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX21Q969T3 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SNX21Q969T3 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SNX21Q969T3 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SNX21Q969T3 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SNX21Q969T3 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
SNX21Q969T3 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
SNX21Q969T3 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SNX21Q969T3 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
SNX21Q969T3 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SNX21Q969T3 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SNX21Q969T3 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SNX21Q969T3 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SNX21Q969T3 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
SNX21Q969T3 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
SNX21Q969T3 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
SNX21Q969T3 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
SNX21Q969T3 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
SNX21Q969T3 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
SNX21Q969T3 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
SNX21Q969T3 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
SNX21Q969T3 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
SNX21Q969T3 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SNX21Q969T3 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SNX21Q969T3 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SNX21Q969T3 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SNX21Q969T3 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SNX21Q969T3 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
SNX21Q969T3 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SNX21Q969T3 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SNX21Q969T3 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SNX21Q969T3 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SNX21Q969T3 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SNX21Q969T3 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SNX21Q969T3 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SNX21Q969T3 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SNX21Q969T3 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SNX21Q969T3 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SNX21Q969T3 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SNX21Q969T3 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SNX21Q969T3 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SNX21Q969T3 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SNX21Q969T3 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SNX21Q969T3 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SNX21Q969T3 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SNX21Q969T3 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SNX21Q969T3 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SNX21Q969T3 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SNX21Q969T3 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SNX21Q969T3 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SNX21Q969T3 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SNX21Q969T3 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SNX21Q969T3 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
SNX21Q969T3 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SNX21Q969T3 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SNX21Q969T3 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SNX21Q969T3 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
SNX21Q969T3 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SNX21Q969T3 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SNX21Q969T3 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SNX21Q969T3 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SNX21Q969T3 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SNX21Q969T3 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SNX21Q969T3 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SNX21Q969T3 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SNX21Q969T3 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SNX21Q969T3 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SNX21Q969T3 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SNX21Q969T3 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SNX21Q969T3 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SNX21Q969T3 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SNX21Q969T3 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SNX21Q969T3 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SNX21Q969T3 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SNX21Q969T3 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SNX21Q969T3 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SNX21Q969T3 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
SNX21Q969T3 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SNX21Q969T3 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SNX21Q969T3 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SNX21Q969T3 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SNX21Q969T3 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SNX21Q969T3 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SNX21Q969T3 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SNX21Q969T3 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SNX21Q969T3 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SNX21Q969T3 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SNX21Q969T3 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SNX21Q969T3 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SNX21Q969T3 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SNX21Q969T3 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SNX21Q969T3 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SNX21Q969T3 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SNX21Q969T3 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SNX21Q969T3 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SNX21Q969T3 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SNX21Q969T3 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SNX21Q969T3 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
SNX21Q969T3 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SNX21Q969T3 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SNX21Q969T3 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms