Protein–RNA interactions for Protein: Q969G5

CAVIN3, Caveolae-associated protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAVIN3Q969G5 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CAVIN3Q969G5 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
CAVIN3Q969G5 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CAVIN3Q969G5 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CAVIN3Q969G5 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CAVIN3Q969G5 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CAVIN3Q969G5 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CAVIN3Q969G5 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CAVIN3Q969G5 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CAVIN3Q969G5 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CAVIN3Q969G5 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CAVIN3Q969G5 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CAVIN3Q969G5 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CAVIN3Q969G5 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CAVIN3Q969G5 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CAVIN3Q969G5 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CAVIN3Q969G5 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CAVIN3Q969G5 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CAVIN3Q969G5 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CAVIN3Q969G5 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CAVIN3Q969G5 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CAVIN3Q969G5 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CAVIN3Q969G5 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CAVIN3Q969G5 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CAVIN3Q969G5 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CAVIN3Q969G5 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CAVIN3Q969G5 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
CAVIN3Q969G5 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CAVIN3Q969G5 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CAVIN3Q969G5 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CAVIN3Q969G5 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CAVIN3Q969G5 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CAVIN3Q969G5 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CAVIN3Q969G5 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CAVIN3Q969G5 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
CAVIN3Q969G5 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CAVIN3Q969G5 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CAVIN3Q969G5 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CAVIN3Q969G5 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CAVIN3Q969G5 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CAVIN3Q969G5 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CAVIN3Q969G5 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CAVIN3Q969G5 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CAVIN3Q969G5 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CAVIN3Q969G5 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CAVIN3Q969G5 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CAVIN3Q969G5 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CAVIN3Q969G5 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CAVIN3Q969G5 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CAVIN3Q969G5 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CAVIN3Q969G5 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CAVIN3Q969G5 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
CAVIN3Q969G5 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CAVIN3Q969G5 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
CAVIN3Q969G5 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CAVIN3Q969G5 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CAVIN3Q969G5 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CAVIN3Q969G5 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CAVIN3Q969G5 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CAVIN3Q969G5 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CAVIN3Q969G5 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CAVIN3Q969G5 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CAVIN3Q969G5 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CAVIN3Q969G5 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CAVIN3Q969G5 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CAVIN3Q969G5 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CAVIN3Q969G5 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CAVIN3Q969G5 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CAVIN3Q969G5 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CAVIN3Q969G5 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
CAVIN3Q969G5 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CAVIN3Q969G5 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CAVIN3Q969G5 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CAVIN3Q969G5 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
CAVIN3Q969G5 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CAVIN3Q969G5 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CAVIN3Q969G5 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CAVIN3Q969G5 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CAVIN3Q969G5 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CAVIN3Q969G5 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CAVIN3Q969G5 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CAVIN3Q969G5 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CAVIN3Q969G5 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CAVIN3Q969G5 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
CAVIN3Q969G5 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
CAVIN3Q969G5 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CAVIN3Q969G5 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CAVIN3Q969G5 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CAVIN3Q969G5 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CAVIN3Q969G5 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CAVIN3Q969G5 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CAVIN3Q969G5 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CAVIN3Q969G5 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CAVIN3Q969G5 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CAVIN3Q969G5 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CAVIN3Q969G5 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
CAVIN3Q969G5 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CAVIN3Q969G5 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CAVIN3Q969G5 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CAVIN3Q969G5 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms