Protein–RNA interactions for Protein: Q969G3

SMARCE1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily E member 1, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCE1Q969G3 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SMARCE1Q969G3 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SMARCE1Q969G3 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SMARCE1Q969G3 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SMARCE1Q969G3 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SMARCE1Q969G3 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SMARCE1Q969G3 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SMARCE1Q969G3 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SMARCE1Q969G3 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SMARCE1Q969G3 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SMARCE1Q969G3 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SMARCE1Q969G3 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SMARCE1Q969G3 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SMARCE1Q969G3 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SMARCE1Q969G3 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SMARCE1Q969G3 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SMARCE1Q969G3 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SMARCE1Q969G3 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SMARCE1Q969G3 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SMARCE1Q969G3 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SMARCE1Q969G3 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SMARCE1Q969G3 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SMARCE1Q969G3 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SMARCE1Q969G3 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SMARCE1Q969G3 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SMARCE1Q969G3 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SMARCE1Q969G3 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SMARCE1Q969G3 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SMARCE1Q969G3 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SMARCE1Q969G3 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SMARCE1Q969G3 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SMARCE1Q969G3 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SMARCE1Q969G3 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SMARCE1Q969G3 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SMARCE1Q969G3 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SMARCE1Q969G3 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SMARCE1Q969G3 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
SMARCE1Q969G3 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SMARCE1Q969G3 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SMARCE1Q969G3 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SMARCE1Q969G3 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
SMARCE1Q969G3 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SMARCE1Q969G3 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
SMARCE1Q969G3 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SMARCE1Q969G3 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SMARCE1Q969G3 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SMARCE1Q969G3 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SMARCE1Q969G3 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SMARCE1Q969G3 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SMARCE1Q969G3 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
SMARCE1Q969G3 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SMARCE1Q969G3 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SMARCE1Q969G3 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SMARCE1Q969G3 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SMARCE1Q969G3 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SMARCE1Q969G3 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SMARCE1Q969G3 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SMARCE1Q969G3 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SMARCE1Q969G3 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SMARCE1Q969G3 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SMARCE1Q969G3 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SMARCE1Q969G3 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SMARCE1Q969G3 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SMARCE1Q969G3 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SMARCE1Q969G3 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SMARCE1Q969G3 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SMARCE1Q969G3 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SMARCE1Q969G3 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SMARCE1Q969G3 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
SMARCE1Q969G3 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
SMARCE1Q969G3 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SMARCE1Q969G3 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SMARCE1Q969G3 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
SMARCE1Q969G3 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SMARCE1Q969G3 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SMARCE1Q969G3 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SMARCE1Q969G3 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SMARCE1Q969G3 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SMARCE1Q969G3 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SMARCE1Q969G3 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SMARCE1Q969G3 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SMARCE1Q969G3 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SMARCE1Q969G3 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SMARCE1Q969G3 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SMARCE1Q969G3 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SMARCE1Q969G3 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SMARCE1Q969G3 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SMARCE1Q969G3 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SMARCE1Q969G3 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SMARCE1Q969G3 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SMARCE1Q969G3 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SMARCE1Q969G3 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SMARCE1Q969G3 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SMARCE1Q969G3 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SMARCE1Q969G3 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SMARCE1Q969G3 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
SMARCE1Q969G3 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SMARCE1Q969G3 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
SMARCE1Q969G3 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SMARCE1Q969G3 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms