Protein–RNA interactions for Protein: Q92901

RPL3L, 60S ribosomal protein L3-like, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 407 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL3LQ92901 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RPL3LQ92901 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
RPL3LQ92901 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RPL3LQ92901 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RPL3LQ92901 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RPL3LQ92901 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RPL3LQ92901 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RPL3LQ92901 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RPL3LQ92901 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RPL3LQ92901 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RPL3LQ92901 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RPL3LQ92901 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RPL3LQ92901 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RPL3LQ92901 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RPL3LQ92901 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RPL3LQ92901 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RPL3LQ92901 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RPL3LQ92901 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
RPL3LQ92901 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RPL3LQ92901 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
RPL3LQ92901 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
RPL3LQ92901 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RPL3LQ92901 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RPL3LQ92901 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RPL3LQ92901 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RPL3LQ92901 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RPL3LQ92901 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RPL3LQ92901 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RPL3LQ92901 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
RPL3LQ92901 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RPL3LQ92901 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RPL3LQ92901 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RPL3LQ92901 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RPL3LQ92901 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RPL3LQ92901 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RPL3LQ92901 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RPL3LQ92901 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RPL3LQ92901 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RPL3LQ92901 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RPL3LQ92901 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RPL3LQ92901 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RPL3LQ92901 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RPL3LQ92901 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RPL3LQ92901 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RPL3LQ92901 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RPL3LQ92901 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RPL3LQ92901 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RPL3LQ92901 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RPL3LQ92901 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RPL3LQ92901 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RPL3LQ92901 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RPL3LQ92901 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RPL3LQ92901 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RPL3LQ92901 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RPL3LQ92901 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RPL3LQ92901 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RPL3LQ92901 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RPL3LQ92901 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RPL3LQ92901 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RPL3LQ92901 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RPL3LQ92901 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RPL3LQ92901 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RPL3LQ92901 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RPL3LQ92901 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RPL3LQ92901 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RPL3LQ92901 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RPL3LQ92901 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RPL3LQ92901 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RPL3LQ92901 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RPL3LQ92901 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RPL3LQ92901 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RPL3LQ92901 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RPL3LQ92901 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RPL3LQ92901 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RPL3LQ92901 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RPL3LQ92901 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RPL3LQ92901 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RPL3LQ92901 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RPL3LQ92901 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RPL3LQ92901 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RPL3LQ92901 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RPL3LQ92901 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RPL3LQ92901 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RPL3LQ92901 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RPL3LQ92901 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RPL3LQ92901 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RPL3LQ92901 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RPL3LQ92901 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RPL3LQ92901 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RPL3LQ92901 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RPL3LQ92901 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RPL3LQ92901 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
RPL3LQ92901 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RPL3LQ92901 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RPL3LQ92901 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RPL3LQ92901 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RPL3LQ92901 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RPL3LQ92901 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RPL3LQ92901 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RPL3LQ92901 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.9 ms