Protein–RNA interactions for Protein: Q92616

GCN1, eIF-2-alpha kinase activator GCN1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,671 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCN1Q92616 HHEX-203ENST00000492654 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GCN1Q92616 GSTZ1-219ENST00000557639 873 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GCN1Q92616 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GCN1Q92616 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GCN1Q92616 PSENEN-203ENST00000591949 833 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GCN1Q92616 AC106017.2-201ENST00000631194 1173 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GCN1Q92616 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GCN1Q92616 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GCN1Q92616 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GCN1Q92616 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GCN1Q92616 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GCN1Q92616 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GCN1Q92616 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GCN1Q92616 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GCN1Q92616 C1orf68-201ENST00000368775 949 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GCN1Q92616 GGTLC2-202ENST00000448514 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GCN1Q92616 MALAT1-211ENST00000617791 394 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GCN1Q92616 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GCN1Q92616 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GCN1Q92616 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GCN1Q92616 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GCN1Q92616 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GCN1Q92616 UBE2T-201ENST00000367274 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GCN1Q92616 RPL13A-201ENST00000391857 1181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GCN1Q92616 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GCN1Q92616 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
GCN1Q92616 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GCN1Q92616 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GCN1Q92616 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GCN1Q92616 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GCN1Q92616 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
GCN1Q92616 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GCN1Q92616 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GCN1Q92616 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GCN1Q92616 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GCN1Q92616 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
GCN1Q92616 AC024619.2-201ENST00000581964 517 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GCN1Q92616 TMEM205-208ENST00000587948 688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GCN1Q92616 TMEM205-211ENST00000589555 788 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GCN1Q92616 RHD-204ENST00000417538 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GCN1Q92616 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GCN1Q92616 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GCN1Q92616 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GCN1Q92616 GUSBP2-202ENST00000479900 1203 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GCN1Q92616 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GCN1Q92616 AL139349.1-201ENST00000530479 577 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GCN1Q92616 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GCN1Q92616 TBC1D16-203ENST00000570373 961 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GCN1Q92616 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GCN1Q92616 AURKB-214ENST00000585124 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GCN1Q92616 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GCN1Q92616 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GCN1Q92616 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GCN1Q92616 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GCN1Q92616 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GCN1Q92616 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GCN1Q92616 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GCN1Q92616 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GCN1Q92616 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GCN1Q92616 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
GCN1Q92616 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GCN1Q92616 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GCN1Q92616 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
GCN1Q92616 HIST1H2BPS3-201ENST00000419683 341 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
GCN1Q92616 TSSK5P-201ENST00000423978 907 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
GCN1Q92616 APOC4-201ENST00000591600 348 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GCN1Q92616 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GCN1Q92616 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GCN1Q92616 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GCN1Q92616 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GCN1Q92616 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GCN1Q92616 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GCN1Q92616 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GCN1Q92616 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GCN1Q92616 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
GCN1Q92616 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GCN1Q92616 CC2D2B-203ENST00000423344 1241 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GCN1Q92616 AF274855.1-203ENST00000424126 800 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GCN1Q92616 RHOXF1P1-201ENST00000454625 772 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GCN1Q92616 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GCN1Q92616 LINC01278-203ENST00000608788 820 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GCN1Q92616 LINC01278-207ENST00000610234 555 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GCN1Q92616 IDH3G-212ENST00000619865 1339 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GCN1Q92616 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GCN1Q92616 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GCN1Q92616 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GCN1Q92616 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GCN1Q92616 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GCN1Q92616 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GCN1Q92616 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GCN1Q92616 RNASE10-201ENST00000328444 717 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GCN1Q92616 AC099548.2-209ENST00000480264 625 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
GCN1Q92616 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GCN1Q92616 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GCN1Q92616 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GCN1Q92616 AC012531.2-201ENST00000512206 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GCN1Q92616 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GCN1Q92616 AC100757.3-201ENST00000622361 1406 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
GCN1Q92616 UBB-201ENST00000302182 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GCN1Q92616 GTSF1-201ENST00000305879 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.8 ms