Protein–RNA interactions for Protein: Q92576

PHF3, PHD finger protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,039 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF3Q92576 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PHF3Q92576 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PHF3Q92576 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PHF3Q92576 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PHF3Q92576 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PHF3Q92576 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PHF3Q92576 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PHF3Q92576 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PHF3Q92576 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PHF3Q92576 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PHF3Q92576 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PHF3Q92576 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PHF3Q92576 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PHF3Q92576 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PHF3Q92576 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
PHF3Q92576 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PHF3Q92576 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
PHF3Q92576 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PHF3Q92576 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PHF3Q92576 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PHF3Q92576 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PHF3Q92576 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PHF3Q92576 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PHF3Q92576 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PHF3Q92576 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PHF3Q92576 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
PHF3Q92576 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
PHF3Q92576 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PHF3Q92576 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PHF3Q92576 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
PHF3Q92576 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PHF3Q92576 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
PHF3Q92576 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PHF3Q92576 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PHF3Q92576 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PHF3Q92576 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PHF3Q92576 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PHF3Q92576 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PHF3Q92576 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PHF3Q92576 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PHF3Q92576 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PHF3Q92576 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PHF3Q92576 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PHF3Q92576 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PHF3Q92576 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PHF3Q92576 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PHF3Q92576 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PHF3Q92576 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PHF3Q92576 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PHF3Q92576 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
PHF3Q92576 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
PHF3Q92576 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PHF3Q92576 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PHF3Q92576 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PHF3Q92576 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PHF3Q92576 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PHF3Q92576 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PHF3Q92576 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PHF3Q92576 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PHF3Q92576 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PHF3Q92576 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PHF3Q92576 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PHF3Q92576 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PHF3Q92576 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
PHF3Q92576 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PHF3Q92576 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PHF3Q92576 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
PHF3Q92576 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PHF3Q92576 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PHF3Q92576 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
PHF3Q92576 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
PHF3Q92576 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
PHF3Q92576 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
PHF3Q92576 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
PHF3Q92576 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
PHF3Q92576 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
PHF3Q92576 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PHF3Q92576 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PHF3Q92576 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PHF3Q92576 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PHF3Q92576 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
PHF3Q92576 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PHF3Q92576 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PHF3Q92576 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PHF3Q92576 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PHF3Q92576 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PHF3Q92576 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PHF3Q92576 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PHF3Q92576 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PHF3Q92576 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PHF3Q92576 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PHF3Q92576 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PHF3Q92576 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PHF3Q92576 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PHF3Q92576 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PHF3Q92576 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PHF3Q92576 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PHF3Q92576 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PHF3Q92576 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PHF3Q92576 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.5 ms