Protein–RNA interactions for Protein: Q8WYN3

CSRNP3, Cysteine/serine-rich nuclear protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 585 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSRNP3Q8WYN3 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
CSRNP3Q8WYN3 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
CSRNP3Q8WYN3 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
CSRNP3Q8WYN3 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC29.33■■■□□ 2.29
CSRNP3Q8WYN3 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
CSRNP3Q8WYN3 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
CSRNP3Q8WYN3 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
CSRNP3Q8WYN3 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
CSRNP3Q8WYN3 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
CSRNP3Q8WYN3 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC29.33■■■□□ 2.29
CSRNP3Q8WYN3 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC29.33■■■□□ 2.29
CSRNP3Q8WYN3 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
CSRNP3Q8WYN3 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
CSRNP3Q8WYN3 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
CSRNP3Q8WYN3 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
CSRNP3Q8WYN3 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
CSRNP3Q8WYN3 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
CSRNP3Q8WYN3 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
CSRNP3Q8WYN3 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
CSRNP3Q8WYN3 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
CSRNP3Q8WYN3 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
CSRNP3Q8WYN3 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
CSRNP3Q8WYN3 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
CSRNP3Q8WYN3 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
CSRNP3Q8WYN3 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
CSRNP3Q8WYN3 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
CSRNP3Q8WYN3 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
CSRNP3Q8WYN3 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
CSRNP3Q8WYN3 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
CSRNP3Q8WYN3 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
CSRNP3Q8WYN3 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
CSRNP3Q8WYN3 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
CSRNP3Q8WYN3 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC29.32■■■□□ 2.28
CSRNP3Q8WYN3 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
CSRNP3Q8WYN3 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
CSRNP3Q8WYN3 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
CSRNP3Q8WYN3 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
CSRNP3Q8WYN3 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
CSRNP3Q8WYN3 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
CSRNP3Q8WYN3 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
CSRNP3Q8WYN3 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
CSRNP3Q8WYN3 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
CSRNP3Q8WYN3 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
CSRNP3Q8WYN3 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
CSRNP3Q8WYN3 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
CSRNP3Q8WYN3 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
CSRNP3Q8WYN3 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
CSRNP3Q8WYN3 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
CSRNP3Q8WYN3 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
CSRNP3Q8WYN3 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
CSRNP3Q8WYN3 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
CSRNP3Q8WYN3 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
CSRNP3Q8WYN3 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
CSRNP3Q8WYN3 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
CSRNP3Q8WYN3 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
CSRNP3Q8WYN3 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
CSRNP3Q8WYN3 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
CSRNP3Q8WYN3 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
CSRNP3Q8WYN3 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
CSRNP3Q8WYN3 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
CSRNP3Q8WYN3 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
CSRNP3Q8WYN3 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
CSRNP3Q8WYN3 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC29.3■■■□□ 2.28
CSRNP3Q8WYN3 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
CSRNP3Q8WYN3 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
CSRNP3Q8WYN3 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
CSRNP3Q8WYN3 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
CSRNP3Q8WYN3 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
CSRNP3Q8WYN3 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
CSRNP3Q8WYN3 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
CSRNP3Q8WYN3 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
CSRNP3Q8WYN3 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC29.3■■■□□ 2.28
CSRNP3Q8WYN3 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
CSRNP3Q8WYN3 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
CSRNP3Q8WYN3 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
CSRNP3Q8WYN3 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
CSRNP3Q8WYN3 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
CSRNP3Q8WYN3 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
CSRNP3Q8WYN3 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
CSRNP3Q8WYN3 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC29.29■■■□□ 2.28
CSRNP3Q8WYN3 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
CSRNP3Q8WYN3 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
CSRNP3Q8WYN3 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
CSRNP3Q8WYN3 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC29.29■■■□□ 2.28
CSRNP3Q8WYN3 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
CSRNP3Q8WYN3 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC29.29■■■□□ 2.28
CSRNP3Q8WYN3 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
CSRNP3Q8WYN3 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
CSRNP3Q8WYN3 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
CSRNP3Q8WYN3 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
CSRNP3Q8WYN3 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
CSRNP3Q8WYN3 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
CSRNP3Q8WYN3 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
CSRNP3Q8WYN3 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC29.28■■■□□ 2.28
CSRNP3Q8WYN3 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
CSRNP3Q8WYN3 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
CSRNP3Q8WYN3 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC29.28■■■□□ 2.28
CSRNP3Q8WYN3 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC29.28■■■□□ 2.28
CSRNP3Q8WYN3 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
CSRNP3Q8WYN3 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC29.28■■■□□ 2.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.1 ms