Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEP4

C17orf47, Uncharacterized protein C17orf47, humanhuman

Predictions only

Length 570 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C17orf47Q8NEP4 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
C17orf47Q8NEP4 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
C17orf47Q8NEP4 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
C17orf47Q8NEP4 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
C17orf47Q8NEP4 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
C17orf47Q8NEP4 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
C17orf47Q8NEP4 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
C17orf47Q8NEP4 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
C17orf47Q8NEP4 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
C17orf47Q8NEP4 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
C17orf47Q8NEP4 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
C17orf47Q8NEP4 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
C17orf47Q8NEP4 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
C17orf47Q8NEP4 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
C17orf47Q8NEP4 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
C17orf47Q8NEP4 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
C17orf47Q8NEP4 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
C17orf47Q8NEP4 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
C17orf47Q8NEP4 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
C17orf47Q8NEP4 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
C17orf47Q8NEP4 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
C17orf47Q8NEP4 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
C17orf47Q8NEP4 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
C17orf47Q8NEP4 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
C17orf47Q8NEP4 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
C17orf47Q8NEP4 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
C17orf47Q8NEP4 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
C17orf47Q8NEP4 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
C17orf47Q8NEP4 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
C17orf47Q8NEP4 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC16.74■□□□□ 0.27
C17orf47Q8NEP4 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
C17orf47Q8NEP4 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
C17orf47Q8NEP4 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
C17orf47Q8NEP4 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
C17orf47Q8NEP4 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
C17orf47Q8NEP4 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
C17orf47Q8NEP4 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
C17orf47Q8NEP4 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
C17orf47Q8NEP4 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
C17orf47Q8NEP4 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
C17orf47Q8NEP4 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
C17orf47Q8NEP4 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
C17orf47Q8NEP4 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
C17orf47Q8NEP4 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
C17orf47Q8NEP4 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
C17orf47Q8NEP4 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
C17orf47Q8NEP4 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
C17orf47Q8NEP4 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
C17orf47Q8NEP4 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
C17orf47Q8NEP4 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
C17orf47Q8NEP4 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
C17orf47Q8NEP4 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
C17orf47Q8NEP4 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
C17orf47Q8NEP4 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
C17orf47Q8NEP4 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
C17orf47Q8NEP4 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
C17orf47Q8NEP4 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
C17orf47Q8NEP4 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
C17orf47Q8NEP4 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
C17orf47Q8NEP4 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
C17orf47Q8NEP4 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
C17orf47Q8NEP4 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC16.73■□□□□ 0.27
C17orf47Q8NEP4 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
C17orf47Q8NEP4 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
C17orf47Q8NEP4 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
C17orf47Q8NEP4 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
C17orf47Q8NEP4 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
C17orf47Q8NEP4 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
C17orf47Q8NEP4 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
C17orf47Q8NEP4 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
C17orf47Q8NEP4 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
C17orf47Q8NEP4 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
C17orf47Q8NEP4 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
C17orf47Q8NEP4 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
C17orf47Q8NEP4 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
C17orf47Q8NEP4 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
C17orf47Q8NEP4 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
C17orf47Q8NEP4 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
C17orf47Q8NEP4 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
C17orf47Q8NEP4 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
C17orf47Q8NEP4 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
C17orf47Q8NEP4 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
C17orf47Q8NEP4 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
C17orf47Q8NEP4 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
C17orf47Q8NEP4 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
C17orf47Q8NEP4 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
C17orf47Q8NEP4 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
C17orf47Q8NEP4 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
C17orf47Q8NEP4 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
C17orf47Q8NEP4 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
C17orf47Q8NEP4 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
C17orf47Q8NEP4 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
C17orf47Q8NEP4 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
C17orf47Q8NEP4 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
C17orf47Q8NEP4 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
C17orf47Q8NEP4 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
C17orf47Q8NEP4 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
C17orf47Q8NEP4 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
C17orf47Q8NEP4 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
C17orf47Q8NEP4 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.5 ms