Protein–RNA interactions for Protein: Q8ND23

CARMIL3, Capping protein, Arp2/3 and myosin-I linker protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CARMIL3Q8ND23 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CARMIL3Q8ND23 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CARMIL3Q8ND23 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CARMIL3Q8ND23 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CARMIL3Q8ND23 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CARMIL3Q8ND23 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CARMIL3Q8ND23 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CARMIL3Q8ND23 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CARMIL3Q8ND23 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CARMIL3Q8ND23 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CARMIL3Q8ND23 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CARMIL3Q8ND23 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CARMIL3Q8ND23 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CARMIL3Q8ND23 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CARMIL3Q8ND23 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CARMIL3Q8ND23 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CARMIL3Q8ND23 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
CARMIL3Q8ND23 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
CARMIL3Q8ND23 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CARMIL3Q8ND23 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CARMIL3Q8ND23 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
CARMIL3Q8ND23 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
CARMIL3Q8ND23 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CARMIL3Q8ND23 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CARMIL3Q8ND23 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CARMIL3Q8ND23 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CARMIL3Q8ND23 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CARMIL3Q8ND23 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CARMIL3Q8ND23 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CARMIL3Q8ND23 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CARMIL3Q8ND23 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CARMIL3Q8ND23 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CARMIL3Q8ND23 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CARMIL3Q8ND23 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CARMIL3Q8ND23 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CARMIL3Q8ND23 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.19
CARMIL3Q8ND23 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
CARMIL3Q8ND23 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CARMIL3Q8ND23 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CARMIL3Q8ND23 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
CARMIL3Q8ND23 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CARMIL3Q8ND23 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CARMIL3Q8ND23 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CARMIL3Q8ND23 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CARMIL3Q8ND23 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CARMIL3Q8ND23 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CARMIL3Q8ND23 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CARMIL3Q8ND23 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CARMIL3Q8ND23 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CARMIL3Q8ND23 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CARMIL3Q8ND23 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CARMIL3Q8ND23 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
CARMIL3Q8ND23 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CARMIL3Q8ND23 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CARMIL3Q8ND23 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CARMIL3Q8ND23 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CARMIL3Q8ND23 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CARMIL3Q8ND23 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CARMIL3Q8ND23 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
CARMIL3Q8ND23 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CARMIL3Q8ND23 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CARMIL3Q8ND23 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CARMIL3Q8ND23 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
CARMIL3Q8ND23 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CARMIL3Q8ND23 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CARMIL3Q8ND23 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CARMIL3Q8ND23 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CARMIL3Q8ND23 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CARMIL3Q8ND23 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CARMIL3Q8ND23 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CARMIL3Q8ND23 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CARMIL3Q8ND23 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CARMIL3Q8ND23 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CARMIL3Q8ND23 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CARMIL3Q8ND23 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CARMIL3Q8ND23 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CARMIL3Q8ND23 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
CARMIL3Q8ND23 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CARMIL3Q8ND23 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CARMIL3Q8ND23 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CARMIL3Q8ND23 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
CARMIL3Q8ND23 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CARMIL3Q8ND23 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CARMIL3Q8ND23 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CARMIL3Q8ND23 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CARMIL3Q8ND23 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CARMIL3Q8ND23 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CARMIL3Q8ND23 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CARMIL3Q8ND23 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CARMIL3Q8ND23 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CARMIL3Q8ND23 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CARMIL3Q8ND23 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CARMIL3Q8ND23 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CARMIL3Q8ND23 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
CARMIL3Q8ND23 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CARMIL3Q8ND23 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CARMIL3Q8ND23 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CARMIL3Q8ND23 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CARMIL3Q8ND23 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CARMIL3Q8ND23 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.5 ms