Protein–RNA interactions for Protein: Q8NA47

CCDC63, Coiled-coil domain-containing protein 63, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC63Q8NA47 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CCDC63Q8NA47 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
CCDC63Q8NA47 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CCDC63Q8NA47 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CCDC63Q8NA47 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CCDC63Q8NA47 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CCDC63Q8NA47 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CCDC63Q8NA47 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CCDC63Q8NA47 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CCDC63Q8NA47 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CCDC63Q8NA47 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CCDC63Q8NA47 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CCDC63Q8NA47 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CCDC63Q8NA47 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CCDC63Q8NA47 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CCDC63Q8NA47 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CCDC63Q8NA47 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CCDC63Q8NA47 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CCDC63Q8NA47 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CCDC63Q8NA47 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CCDC63Q8NA47 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CCDC63Q8NA47 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CCDC63Q8NA47 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CCDC63Q8NA47 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CCDC63Q8NA47 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CCDC63Q8NA47 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CCDC63Q8NA47 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CCDC63Q8NA47 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CCDC63Q8NA47 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CCDC63Q8NA47 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CCDC63Q8NA47 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CCDC63Q8NA47 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CCDC63Q8NA47 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CCDC63Q8NA47 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CCDC63Q8NA47 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CCDC63Q8NA47 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CCDC63Q8NA47 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CCDC63Q8NA47 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CCDC63Q8NA47 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
CCDC63Q8NA47 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CCDC63Q8NA47 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CCDC63Q8NA47 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CCDC63Q8NA47 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CCDC63Q8NA47 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CCDC63Q8NA47 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CCDC63Q8NA47 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CCDC63Q8NA47 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CCDC63Q8NA47 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CCDC63Q8NA47 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CCDC63Q8NA47 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CCDC63Q8NA47 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CCDC63Q8NA47 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CCDC63Q8NA47 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CCDC63Q8NA47 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CCDC63Q8NA47 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CCDC63Q8NA47 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CCDC63Q8NA47 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CCDC63Q8NA47 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CCDC63Q8NA47 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CCDC63Q8NA47 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CCDC63Q8NA47 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CCDC63Q8NA47 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CCDC63Q8NA47 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CCDC63Q8NA47 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CCDC63Q8NA47 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CCDC63Q8NA47 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
CCDC63Q8NA47 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CCDC63Q8NA47 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CCDC63Q8NA47 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CCDC63Q8NA47 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CCDC63Q8NA47 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
CCDC63Q8NA47 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CCDC63Q8NA47 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CCDC63Q8NA47 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CCDC63Q8NA47 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CCDC63Q8NA47 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
CCDC63Q8NA47 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
CCDC63Q8NA47 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CCDC63Q8NA47 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CCDC63Q8NA47 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CCDC63Q8NA47 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CCDC63Q8NA47 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CCDC63Q8NA47 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CCDC63Q8NA47 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CCDC63Q8NA47 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CCDC63Q8NA47 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CCDC63Q8NA47 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CCDC63Q8NA47 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CCDC63Q8NA47 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CCDC63Q8NA47 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CCDC63Q8NA47 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CCDC63Q8NA47 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CCDC63Q8NA47 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CCDC63Q8NA47 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CCDC63Q8NA47 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CCDC63Q8NA47 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CCDC63Q8NA47 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CCDC63Q8NA47 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CCDC63Q8NA47 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CCDC63Q8NA47 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms