Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9I9

DTX3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase DTX3, humanhuman

Predictions only

Length 347 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DTX3Q8N9I9 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
DTX3Q8N9I9 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
DTX3Q8N9I9 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
DTX3Q8N9I9 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
DTX3Q8N9I9 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
DTX3Q8N9I9 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
DTX3Q8N9I9 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
DTX3Q8N9I9 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
DTX3Q8N9I9 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
DTX3Q8N9I9 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
DTX3Q8N9I9 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
DTX3Q8N9I9 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
DTX3Q8N9I9 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
DTX3Q8N9I9 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
DTX3Q8N9I9 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
DTX3Q8N9I9 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
DTX3Q8N9I9 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
DTX3Q8N9I9 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
DTX3Q8N9I9 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
DTX3Q8N9I9 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
DTX3Q8N9I9 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
DTX3Q8N9I9 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
DTX3Q8N9I9 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
DTX3Q8N9I9 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
DTX3Q8N9I9 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
DTX3Q8N9I9 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
DTX3Q8N9I9 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
DTX3Q8N9I9 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
DTX3Q8N9I9 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
DTX3Q8N9I9 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
DTX3Q8N9I9 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
DTX3Q8N9I9 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
DTX3Q8N9I9 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
DTX3Q8N9I9 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
DTX3Q8N9I9 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
DTX3Q8N9I9 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
DTX3Q8N9I9 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
DTX3Q8N9I9 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
DTX3Q8N9I9 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
DTX3Q8N9I9 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
DTX3Q8N9I9 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
DTX3Q8N9I9 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
DTX3Q8N9I9 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
DTX3Q8N9I9 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
DTX3Q8N9I9 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
DTX3Q8N9I9 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
DTX3Q8N9I9 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
DTX3Q8N9I9 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
DTX3Q8N9I9 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
DTX3Q8N9I9 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
DTX3Q8N9I9 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
DTX3Q8N9I9 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
DTX3Q8N9I9 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
DTX3Q8N9I9 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
DTX3Q8N9I9 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
DTX3Q8N9I9 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
DTX3Q8N9I9 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
DTX3Q8N9I9 NFE2L2-201ENST00000397062 2853 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
DTX3Q8N9I9 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
DTX3Q8N9I9 HGNC:18790-203ENST00000433139 2254 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
DTX3Q8N9I9 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
DTX3Q8N9I9 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
DTX3Q8N9I9 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
DTX3Q8N9I9 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
DTX3Q8N9I9 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
DTX3Q8N9I9 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
DTX3Q8N9I9 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
DTX3Q8N9I9 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
DTX3Q8N9I9 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
DTX3Q8N9I9 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC16■□□□□ 0.15
DTX3Q8N9I9 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
DTX3Q8N9I9 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
DTX3Q8N9I9 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
DTX3Q8N9I9 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
DTX3Q8N9I9 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
DTX3Q8N9I9 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC16■□□□□ 0.15
DTX3Q8N9I9 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
DTX3Q8N9I9 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC16■□□□□ 0.15
DTX3Q8N9I9 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
DTX3Q8N9I9 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC16■□□□□ 0.15
DTX3Q8N9I9 ST14-201ENST00000278742 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
DTX3Q8N9I9 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
DTX3Q8N9I9 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
DTX3Q8N9I9 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
DTX3Q8N9I9 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
DTX3Q8N9I9 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
DTX3Q8N9I9 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
DTX3Q8N9I9 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
DTX3Q8N9I9 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
DTX3Q8N9I9 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
DTX3Q8N9I9 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
DTX3Q8N9I9 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
DTX3Q8N9I9 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
DTX3Q8N9I9 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
DTX3Q8N9I9 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
DTX3Q8N9I9 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
DTX3Q8N9I9 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
DTX3Q8N9I9 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
DTX3Q8N9I9 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
DTX3Q8N9I9 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms