Protein–RNA interactions for Protein: Q8N4V2

SVOP, Synaptic vesicle 2-related protein, humanhuman

Predictions only

Length 548 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SVOPQ8N4V2 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SVOPQ8N4V2 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SVOPQ8N4V2 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SVOPQ8N4V2 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SVOPQ8N4V2 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SVOPQ8N4V2 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SVOPQ8N4V2 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SVOPQ8N4V2 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SVOPQ8N4V2 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SVOPQ8N4V2 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SVOPQ8N4V2 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SVOPQ8N4V2 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SVOPQ8N4V2 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SVOPQ8N4V2 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SVOPQ8N4V2 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SVOPQ8N4V2 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SVOPQ8N4V2 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SVOPQ8N4V2 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SVOPQ8N4V2 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SVOPQ8N4V2 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SVOPQ8N4V2 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SVOPQ8N4V2 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SVOPQ8N4V2 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SVOPQ8N4V2 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SVOPQ8N4V2 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SVOPQ8N4V2 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SVOPQ8N4V2 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SVOPQ8N4V2 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SVOPQ8N4V2 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SVOPQ8N4V2 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SVOPQ8N4V2 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SVOPQ8N4V2 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SVOPQ8N4V2 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SVOPQ8N4V2 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SVOPQ8N4V2 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SVOPQ8N4V2 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
SVOPQ8N4V2 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SVOPQ8N4V2 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SVOPQ8N4V2 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SVOPQ8N4V2 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SVOPQ8N4V2 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SVOPQ8N4V2 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
SVOPQ8N4V2 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SVOPQ8N4V2 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SVOPQ8N4V2 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SVOPQ8N4V2 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SVOPQ8N4V2 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
SVOPQ8N4V2 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SVOPQ8N4V2 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SVOPQ8N4V2 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SVOPQ8N4V2 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SVOPQ8N4V2 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SVOPQ8N4V2 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SVOPQ8N4V2 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SVOPQ8N4V2 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SVOPQ8N4V2 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SVOPQ8N4V2 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SVOPQ8N4V2 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SVOPQ8N4V2 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SVOPQ8N4V2 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SVOPQ8N4V2 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SVOPQ8N4V2 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SVOPQ8N4V2 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SVOPQ8N4V2 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SVOPQ8N4V2 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SVOPQ8N4V2 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SVOPQ8N4V2 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SVOPQ8N4V2 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SVOPQ8N4V2 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SVOPQ8N4V2 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SVOPQ8N4V2 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SVOPQ8N4V2 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SVOPQ8N4V2 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SVOPQ8N4V2 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SVOPQ8N4V2 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SVOPQ8N4V2 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
SVOPQ8N4V2 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SVOPQ8N4V2 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SVOPQ8N4V2 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SVOPQ8N4V2 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SVOPQ8N4V2 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SVOPQ8N4V2 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SVOPQ8N4V2 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SVOPQ8N4V2 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SVOPQ8N4V2 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SVOPQ8N4V2 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SVOPQ8N4V2 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SVOPQ8N4V2 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SVOPQ8N4V2 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SVOPQ8N4V2 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SVOPQ8N4V2 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SVOPQ8N4V2 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SVOPQ8N4V2 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SVOPQ8N4V2 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SVOPQ8N4V2 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SVOPQ8N4V2 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SVOPQ8N4V2 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SVOPQ8N4V2 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SVOPQ8N4V2 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SVOPQ8N4V2 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.4 ms