Protein–RNA interactions for Protein: Q86SZ2

TRAPPC6B, Trafficking protein particle complex subunit 6B, humanhuman

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Length 158 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC6BQ86SZ2 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
TRAPPC6BQ86SZ2 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
TRAPPC6BQ86SZ2 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
TRAPPC6BQ86SZ2 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
TRAPPC6BQ86SZ2 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
TRAPPC6BQ86SZ2 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
TRAPPC6BQ86SZ2 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
TRAPPC6BQ86SZ2 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
TRAPPC6BQ86SZ2 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC15.65■□□□□ 0.1
TRAPPC6BQ86SZ2 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
TRAPPC6BQ86SZ2 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
TRAPPC6BQ86SZ2 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
TRAPPC6BQ86SZ2 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
TRAPPC6BQ86SZ2 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
TRAPPC6BQ86SZ2 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
TRAPPC6BQ86SZ2 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
TRAPPC6BQ86SZ2 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
TRAPPC6BQ86SZ2 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
TRAPPC6BQ86SZ2 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
TRAPPC6BQ86SZ2 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
TRAPPC6BQ86SZ2 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
TRAPPC6BQ86SZ2 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
TRAPPC6BQ86SZ2 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
TRAPPC6BQ86SZ2 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
TRAPPC6BQ86SZ2 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
TRAPPC6BQ86SZ2 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
TRAPPC6BQ86SZ2 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TRAPPC6BQ86SZ2 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TRAPPC6BQ86SZ2 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TRAPPC6BQ86SZ2 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TRAPPC6BQ86SZ2 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TRAPPC6BQ86SZ2 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TRAPPC6BQ86SZ2 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TRAPPC6BQ86SZ2 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TRAPPC6BQ86SZ2 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TRAPPC6BQ86SZ2 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TRAPPC6BQ86SZ2 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TRAPPC6BQ86SZ2 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TRAPPC6BQ86SZ2 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
TRAPPC6BQ86SZ2 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TRAPPC6BQ86SZ2 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TRAPPC6BQ86SZ2 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TRAPPC6BQ86SZ2 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
TRAPPC6BQ86SZ2 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TRAPPC6BQ86SZ2 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TRAPPC6BQ86SZ2 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TRAPPC6BQ86SZ2 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TRAPPC6BQ86SZ2 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TRAPPC6BQ86SZ2 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TRAPPC6BQ86SZ2 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TRAPPC6BQ86SZ2 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TRAPPC6BQ86SZ2 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TRAPPC6BQ86SZ2 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TRAPPC6BQ86SZ2 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TRAPPC6BQ86SZ2 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TRAPPC6BQ86SZ2 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TRAPPC6BQ86SZ2 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TRAPPC6BQ86SZ2 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TRAPPC6BQ86SZ2 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
TRAPPC6BQ86SZ2 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TRAPPC6BQ86SZ2 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRAPPC6BQ86SZ2 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRAPPC6BQ86SZ2 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRAPPC6BQ86SZ2 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRAPPC6BQ86SZ2 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRAPPC6BQ86SZ2 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRAPPC6BQ86SZ2 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRAPPC6BQ86SZ2 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRAPPC6BQ86SZ2 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRAPPC6BQ86SZ2 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRAPPC6BQ86SZ2 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRAPPC6BQ86SZ2 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRAPPC6BQ86SZ2 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRAPPC6BQ86SZ2 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRAPPC6BQ86SZ2 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRAPPC6BQ86SZ2 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRAPPC6BQ86SZ2 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRAPPC6BQ86SZ2 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
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TRAPPC6BQ86SZ2 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRAPPC6BQ86SZ2 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRAPPC6BQ86SZ2 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRAPPC6BQ86SZ2 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRAPPC6BQ86SZ2 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRAPPC6BQ86SZ2 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRAPPC6BQ86SZ2 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRAPPC6BQ86SZ2 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRAPPC6BQ86SZ2 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
TRAPPC6BQ86SZ2 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRAPPC6BQ86SZ2 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRAPPC6BQ86SZ2 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRAPPC6BQ86SZ2 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRAPPC6BQ86SZ2 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRAPPC6BQ86SZ2 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRAPPC6BQ86SZ2 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRAPPC6BQ86SZ2 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRAPPC6BQ86SZ2 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRAPPC6BQ86SZ2 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRAPPC6BQ86SZ2 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRAPPC6BQ86SZ2 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
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