Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z5U6

WDR53, WD repeat-containing protein 53, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WDR53Q7Z5U6 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
WDR53Q7Z5U6 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
WDR53Q7Z5U6 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
WDR53Q7Z5U6 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
WDR53Q7Z5U6 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
WDR53Q7Z5U6 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
WDR53Q7Z5U6 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
WDR53Q7Z5U6 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
WDR53Q7Z5U6 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
WDR53Q7Z5U6 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
WDR53Q7Z5U6 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
WDR53Q7Z5U6 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
WDR53Q7Z5U6 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
WDR53Q7Z5U6 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
WDR53Q7Z5U6 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
WDR53Q7Z5U6 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
WDR53Q7Z5U6 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
WDR53Q7Z5U6 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
WDR53Q7Z5U6 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
WDR53Q7Z5U6 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
WDR53Q7Z5U6 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
WDR53Q7Z5U6 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
WDR53Q7Z5U6 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC17.02■□□□□ 0.32
WDR53Q7Z5U6 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
WDR53Q7Z5U6 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
WDR53Q7Z5U6 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
WDR53Q7Z5U6 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
WDR53Q7Z5U6 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
WDR53Q7Z5U6 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
WDR53Q7Z5U6 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
WDR53Q7Z5U6 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
WDR53Q7Z5U6 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
WDR53Q7Z5U6 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
WDR53Q7Z5U6 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
WDR53Q7Z5U6 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
WDR53Q7Z5U6 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
WDR53Q7Z5U6 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
WDR53Q7Z5U6 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
WDR53Q7Z5U6 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
WDR53Q7Z5U6 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
WDR53Q7Z5U6 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
WDR53Q7Z5U6 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
WDR53Q7Z5U6 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
WDR53Q7Z5U6 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
WDR53Q7Z5U6 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
WDR53Q7Z5U6 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
WDR53Q7Z5U6 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
WDR53Q7Z5U6 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
WDR53Q7Z5U6 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
WDR53Q7Z5U6 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
WDR53Q7Z5U6 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
WDR53Q7Z5U6 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
WDR53Q7Z5U6 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
WDR53Q7Z5U6 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
WDR53Q7Z5U6 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
WDR53Q7Z5U6 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
WDR53Q7Z5U6 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
WDR53Q7Z5U6 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
WDR53Q7Z5U6 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
WDR53Q7Z5U6 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
WDR53Q7Z5U6 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
WDR53Q7Z5U6 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
WDR53Q7Z5U6 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
WDR53Q7Z5U6 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
WDR53Q7Z5U6 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
WDR53Q7Z5U6 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
WDR53Q7Z5U6 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
WDR53Q7Z5U6 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
WDR53Q7Z5U6 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
WDR53Q7Z5U6 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
WDR53Q7Z5U6 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
WDR53Q7Z5U6 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
WDR53Q7Z5U6 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
WDR53Q7Z5U6 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
WDR53Q7Z5U6 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
WDR53Q7Z5U6 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
WDR53Q7Z5U6 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
WDR53Q7Z5U6 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
WDR53Q7Z5U6 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
WDR53Q7Z5U6 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
WDR53Q7Z5U6 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
WDR53Q7Z5U6 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
WDR53Q7Z5U6 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
WDR53Q7Z5U6 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
WDR53Q7Z5U6 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
WDR53Q7Z5U6 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
WDR53Q7Z5U6 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
WDR53Q7Z5U6 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
WDR53Q7Z5U6 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
WDR53Q7Z5U6 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
WDR53Q7Z5U6 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
WDR53Q7Z5U6 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
WDR53Q7Z5U6 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
WDR53Q7Z5U6 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
WDR53Q7Z5U6 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
WDR53Q7Z5U6 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
WDR53Q7Z5U6 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
WDR53Q7Z5U6 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
WDR53Q7Z5U6 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
WDR53Q7Z5U6 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.9 ms