Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z4L9

PPP1R42, Protein phosphatase 1 regulatory subunit 42, humanhuman

Predictions only

Length 355 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP1R42Q7Z4L9 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PPP1R42Q7Z4L9 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PPP1R42Q7Z4L9 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PPP1R42Q7Z4L9 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PPP1R42Q7Z4L9 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PPP1R42Q7Z4L9 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PPP1R42Q7Z4L9 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PPP1R42Q7Z4L9 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PPP1R42Q7Z4L9 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PPP1R42Q7Z4L9 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PPP1R42Q7Z4L9 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
PPP1R42Q7Z4L9 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PPP1R42Q7Z4L9 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PPP1R42Q7Z4L9 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PPP1R42Q7Z4L9 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PPP1R42Q7Z4L9 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PPP1R42Q7Z4L9 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PPP1R42Q7Z4L9 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PPP1R42Q7Z4L9 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PPP1R42Q7Z4L9 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PPP1R42Q7Z4L9 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PPP1R42Q7Z4L9 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PPP1R42Q7Z4L9 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PPP1R42Q7Z4L9 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PPP1R42Q7Z4L9 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PPP1R42Q7Z4L9 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PPP1R42Q7Z4L9 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PPP1R42Q7Z4L9 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PPP1R42Q7Z4L9 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PPP1R42Q7Z4L9 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PPP1R42Q7Z4L9 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PPP1R42Q7Z4L9 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PPP1R42Q7Z4L9 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PPP1R42Q7Z4L9 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PPP1R42Q7Z4L9 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PPP1R42Q7Z4L9 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PPP1R42Q7Z4L9 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PPP1R42Q7Z4L9 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PPP1R42Q7Z4L9 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PPP1R42Q7Z4L9 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PPP1R42Q7Z4L9 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PPP1R42Q7Z4L9 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PPP1R42Q7Z4L9 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PPP1R42Q7Z4L9 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PPP1R42Q7Z4L9 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PPP1R42Q7Z4L9 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
PPP1R42Q7Z4L9 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PPP1R42Q7Z4L9 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PPP1R42Q7Z4L9 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PPP1R42Q7Z4L9 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PPP1R42Q7Z4L9 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PPP1R42Q7Z4L9 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PPP1R42Q7Z4L9 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PPP1R42Q7Z4L9 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PPP1R42Q7Z4L9 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PPP1R42Q7Z4L9 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PPP1R42Q7Z4L9 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PPP1R42Q7Z4L9 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
PPP1R42Q7Z4L9 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PPP1R42Q7Z4L9 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PPP1R42Q7Z4L9 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PPP1R42Q7Z4L9 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PPP1R42Q7Z4L9 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PPP1R42Q7Z4L9 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PPP1R42Q7Z4L9 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PPP1R42Q7Z4L9 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PPP1R42Q7Z4L9 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PPP1R42Q7Z4L9 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PPP1R42Q7Z4L9 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PPP1R42Q7Z4L9 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PPP1R42Q7Z4L9 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PPP1R42Q7Z4L9 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
PPP1R42Q7Z4L9 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PPP1R42Q7Z4L9 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PPP1R42Q7Z4L9 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PPP1R42Q7Z4L9 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PPP1R42Q7Z4L9 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PPP1R42Q7Z4L9 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PPP1R42Q7Z4L9 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PPP1R42Q7Z4L9 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PPP1R42Q7Z4L9 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PPP1R42Q7Z4L9 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PPP1R42Q7Z4L9 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PPP1R42Q7Z4L9 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PPP1R42Q7Z4L9 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PPP1R42Q7Z4L9 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PPP1R42Q7Z4L9 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PPP1R42Q7Z4L9 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PPP1R42Q7Z4L9 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PPP1R42Q7Z4L9 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PPP1R42Q7Z4L9 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PPP1R42Q7Z4L9 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PPP1R42Q7Z4L9 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PPP1R42Q7Z4L9 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PPP1R42Q7Z4L9 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
PPP1R42Q7Z4L9 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PPP1R42Q7Z4L9 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PPP1R42Q7Z4L9 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PPP1R42Q7Z4L9 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PPP1R42Q7Z4L9 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms