Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZW31

SYDE1, Rho GTPase-activating protein SYDE1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 735 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYDE1Q6ZW31 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SYDE1Q6ZW31 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
SYDE1Q6ZW31 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SYDE1Q6ZW31 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SYDE1Q6ZW31 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SYDE1Q6ZW31 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SYDE1Q6ZW31 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SYDE1Q6ZW31 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SYDE1Q6ZW31 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SYDE1Q6ZW31 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SYDE1Q6ZW31 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SYDE1Q6ZW31 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SYDE1Q6ZW31 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SYDE1Q6ZW31 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SYDE1Q6ZW31 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SYDE1Q6ZW31 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SYDE1Q6ZW31 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SYDE1Q6ZW31 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SYDE1Q6ZW31 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SYDE1Q6ZW31 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SYDE1Q6ZW31 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
SYDE1Q6ZW31 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SYDE1Q6ZW31 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SYDE1Q6ZW31 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SYDE1Q6ZW31 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
SYDE1Q6ZW31 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
SYDE1Q6ZW31 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SYDE1Q6ZW31 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SYDE1Q6ZW31 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SYDE1Q6ZW31 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
SYDE1Q6ZW31 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SYDE1Q6ZW31 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SYDE1Q6ZW31 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SYDE1Q6ZW31 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SYDE1Q6ZW31 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
SYDE1Q6ZW31 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SYDE1Q6ZW31 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
SYDE1Q6ZW31 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SYDE1Q6ZW31 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SYDE1Q6ZW31 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SYDE1Q6ZW31 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SYDE1Q6ZW31 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SYDE1Q6ZW31 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SYDE1Q6ZW31 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SYDE1Q6ZW31 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SYDE1Q6ZW31 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SYDE1Q6ZW31 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SYDE1Q6ZW31 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
SYDE1Q6ZW31 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SYDE1Q6ZW31 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SYDE1Q6ZW31 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SYDE1Q6ZW31 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SYDE1Q6ZW31 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SYDE1Q6ZW31 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SYDE1Q6ZW31 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SYDE1Q6ZW31 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SYDE1Q6ZW31 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SYDE1Q6ZW31 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SYDE1Q6ZW31 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
SYDE1Q6ZW31 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SYDE1Q6ZW31 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SYDE1Q6ZW31 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SYDE1Q6ZW31 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SYDE1Q6ZW31 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SYDE1Q6ZW31 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SYDE1Q6ZW31 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SYDE1Q6ZW31 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SYDE1Q6ZW31 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SYDE1Q6ZW31 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SYDE1Q6ZW31 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SYDE1Q6ZW31 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SYDE1Q6ZW31 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SYDE1Q6ZW31 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
SYDE1Q6ZW31 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SYDE1Q6ZW31 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SYDE1Q6ZW31 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SYDE1Q6ZW31 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SYDE1Q6ZW31 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SYDE1Q6ZW31 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SYDE1Q6ZW31 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SYDE1Q6ZW31 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SYDE1Q6ZW31 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SYDE1Q6ZW31 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SYDE1Q6ZW31 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SYDE1Q6ZW31 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SYDE1Q6ZW31 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SYDE1Q6ZW31 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SYDE1Q6ZW31 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SYDE1Q6ZW31 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
SYDE1Q6ZW31 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SYDE1Q6ZW31 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SYDE1Q6ZW31 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SYDE1Q6ZW31 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SYDE1Q6ZW31 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SYDE1Q6ZW31 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SYDE1Q6ZW31 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SYDE1Q6ZW31 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SYDE1Q6ZW31 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
SYDE1Q6ZW31 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SYDE1Q6ZW31 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms