Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZV77

C9orf139, Uncharacterized protein C9orf139, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf139Q6ZV77 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
C9orf139Q6ZV77 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
C9orf139Q6ZV77 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
C9orf139Q6ZV77 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
C9orf139Q6ZV77 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
C9orf139Q6ZV77 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
C9orf139Q6ZV77 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
C9orf139Q6ZV77 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
C9orf139Q6ZV77 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
C9orf139Q6ZV77 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
C9orf139Q6ZV77 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
C9orf139Q6ZV77 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
C9orf139Q6ZV77 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
C9orf139Q6ZV77 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
C9orf139Q6ZV77 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
C9orf139Q6ZV77 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
C9orf139Q6ZV77 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
C9orf139Q6ZV77 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
C9orf139Q6ZV77 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
C9orf139Q6ZV77 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
C9orf139Q6ZV77 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
C9orf139Q6ZV77 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
C9orf139Q6ZV77 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
C9orf139Q6ZV77 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
C9orf139Q6ZV77 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
C9orf139Q6ZV77 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
C9orf139Q6ZV77 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
C9orf139Q6ZV77 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
C9orf139Q6ZV77 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
C9orf139Q6ZV77 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
C9orf139Q6ZV77 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
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C9orf139Q6ZV77 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
C9orf139Q6ZV77 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
C9orf139Q6ZV77 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
C9orf139Q6ZV77 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
C9orf139Q6ZV77 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
C9orf139Q6ZV77 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
C9orf139Q6ZV77 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
C9orf139Q6ZV77 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
C9orf139Q6ZV77 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
C9orf139Q6ZV77 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
C9orf139Q6ZV77 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
C9orf139Q6ZV77 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
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C9orf139Q6ZV77 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
C9orf139Q6ZV77 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
C9orf139Q6ZV77 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
C9orf139Q6ZV77 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
C9orf139Q6ZV77 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
C9orf139Q6ZV77 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
C9orf139Q6ZV77 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
C9orf139Q6ZV77 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
C9orf139Q6ZV77 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
C9orf139Q6ZV77 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
C9orf139Q6ZV77 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
C9orf139Q6ZV77 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
C9orf139Q6ZV77 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
C9orf139Q6ZV77 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
C9orf139Q6ZV77 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
C9orf139Q6ZV77 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
C9orf139Q6ZV77 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
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C9orf139Q6ZV77 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
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C9orf139Q6ZV77 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
C9orf139Q6ZV77 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
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C9orf139Q6ZV77 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
C9orf139Q6ZV77 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
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C9orf139Q6ZV77 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC14.55□□□□□ -0.08
C9orf139Q6ZV77 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
C9orf139Q6ZV77 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
C9orf139Q6ZV77 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
C9orf139Q6ZV77 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
C9orf139Q6ZV77 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
C9orf139Q6ZV77 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
C9orf139Q6ZV77 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
C9orf139Q6ZV77 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
C9orf139Q6ZV77 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
C9orf139Q6ZV77 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
C9orf139Q6ZV77 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
C9orf139Q6ZV77 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
C9orf139Q6ZV77 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
C9orf139Q6ZV77 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
C9orf139Q6ZV77 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
C9orf139Q6ZV77 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
C9orf139Q6ZV77 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
C9orf139Q6ZV77 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
C9orf139Q6ZV77 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
C9orf139Q6ZV77 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
C9orf139Q6ZV77 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
C9orf139Q6ZV77 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
C9orf139Q6ZV77 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
C9orf139Q6ZV77 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
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