Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZT07

TBC1D9, TBC1 domain family member 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,266 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TBC1D9Q6ZT07 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TBC1D9Q6ZT07 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TBC1D9Q6ZT07 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TBC1D9Q6ZT07 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TBC1D9Q6ZT07 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TBC1D9Q6ZT07 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TBC1D9Q6ZT07 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TBC1D9Q6ZT07 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TBC1D9Q6ZT07 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TBC1D9Q6ZT07 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TBC1D9Q6ZT07 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TBC1D9Q6ZT07 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TBC1D9Q6ZT07 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TBC1D9Q6ZT07 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
TBC1D9Q6ZT07 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
TBC1D9Q6ZT07 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
TBC1D9Q6ZT07 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TBC1D9Q6ZT07 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TBC1D9Q6ZT07 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TBC1D9Q6ZT07 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
TBC1D9Q6ZT07 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TBC1D9Q6ZT07 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TBC1D9Q6ZT07 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TBC1D9Q6ZT07 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TBC1D9Q6ZT07 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TBC1D9Q6ZT07 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TBC1D9Q6ZT07 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TBC1D9Q6ZT07 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TBC1D9Q6ZT07 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TBC1D9Q6ZT07 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TBC1D9Q6ZT07 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TBC1D9Q6ZT07 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TBC1D9Q6ZT07 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TBC1D9Q6ZT07 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
TBC1D9Q6ZT07 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
TBC1D9Q6ZT07 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TBC1D9Q6ZT07 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TBC1D9Q6ZT07 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TBC1D9Q6ZT07 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TBC1D9Q6ZT07 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TBC1D9Q6ZT07 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TBC1D9Q6ZT07 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TBC1D9Q6ZT07 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
TBC1D9Q6ZT07 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TBC1D9Q6ZT07 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TBC1D9Q6ZT07 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TBC1D9Q6ZT07 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TBC1D9Q6ZT07 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TBC1D9Q6ZT07 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TBC1D9Q6ZT07 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TBC1D9Q6ZT07 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TBC1D9Q6ZT07 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TBC1D9Q6ZT07 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TBC1D9Q6ZT07 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TBC1D9Q6ZT07 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TBC1D9Q6ZT07 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TBC1D9Q6ZT07 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TBC1D9Q6ZT07 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TBC1D9Q6ZT07 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
TBC1D9Q6ZT07 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
TBC1D9Q6ZT07 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
TBC1D9Q6ZT07 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TBC1D9Q6ZT07 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TBC1D9Q6ZT07 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TBC1D9Q6ZT07 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TBC1D9Q6ZT07 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TBC1D9Q6ZT07 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TBC1D9Q6ZT07 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TBC1D9Q6ZT07 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TBC1D9Q6ZT07 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TBC1D9Q6ZT07 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
TBC1D9Q6ZT07 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TBC1D9Q6ZT07 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TBC1D9Q6ZT07 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TBC1D9Q6ZT07 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
TBC1D9Q6ZT07 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TBC1D9Q6ZT07 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TBC1D9Q6ZT07 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TBC1D9Q6ZT07 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TBC1D9Q6ZT07 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TBC1D9Q6ZT07 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TBC1D9Q6ZT07 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TBC1D9Q6ZT07 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TBC1D9Q6ZT07 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TBC1D9Q6ZT07 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TBC1D9Q6ZT07 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TBC1D9Q6ZT07 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TBC1D9Q6ZT07 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TBC1D9Q6ZT07 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TBC1D9Q6ZT07 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TBC1D9Q6ZT07 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TBC1D9Q6ZT07 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
TBC1D9Q6ZT07 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
TBC1D9Q6ZT07 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
TBC1D9Q6ZT07 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TBC1D9Q6ZT07 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TBC1D9Q6ZT07 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TBC1D9Q6ZT07 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TBC1D9Q6ZT07 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TBC1D9Q6ZT07 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.2 ms