Protein–RNA interactions for Protein: Q6P5Q4

LMOD2, Leiomodin-2, humanhuman

Predictions only

Length 547 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMOD2Q6P5Q4 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
LMOD2Q6P5Q4 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
LMOD2Q6P5Q4 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
LMOD2Q6P5Q4 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
LMOD2Q6P5Q4 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
LMOD2Q6P5Q4 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
LMOD2Q6P5Q4 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
LMOD2Q6P5Q4 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
LMOD2Q6P5Q4 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
LMOD2Q6P5Q4 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
LMOD2Q6P5Q4 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
LMOD2Q6P5Q4 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
LMOD2Q6P5Q4 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
LMOD2Q6P5Q4 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
LMOD2Q6P5Q4 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
LMOD2Q6P5Q4 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
LMOD2Q6P5Q4 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
LMOD2Q6P5Q4 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
LMOD2Q6P5Q4 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
LMOD2Q6P5Q4 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
LMOD2Q6P5Q4 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
LMOD2Q6P5Q4 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
LMOD2Q6P5Q4 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
LMOD2Q6P5Q4 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
LMOD2Q6P5Q4 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
LMOD2Q6P5Q4 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
LMOD2Q6P5Q4 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
LMOD2Q6P5Q4 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
LMOD2Q6P5Q4 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
LMOD2Q6P5Q4 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
LMOD2Q6P5Q4 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
LMOD2Q6P5Q4 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
LMOD2Q6P5Q4 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
LMOD2Q6P5Q4 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
LMOD2Q6P5Q4 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
LMOD2Q6P5Q4 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
LMOD2Q6P5Q4 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
LMOD2Q6P5Q4 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
LMOD2Q6P5Q4 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
LMOD2Q6P5Q4 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
LMOD2Q6P5Q4 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
LMOD2Q6P5Q4 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
LMOD2Q6P5Q4 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
LMOD2Q6P5Q4 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
LMOD2Q6P5Q4 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
LMOD2Q6P5Q4 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
LMOD2Q6P5Q4 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
LMOD2Q6P5Q4 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC24.4■■□□□ 1.5
LMOD2Q6P5Q4 MIR3197-201ENST00000582241 73 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
LMOD2Q6P5Q4 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
LMOD2Q6P5Q4 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
LMOD2Q6P5Q4 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
LMOD2Q6P5Q4 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
LMOD2Q6P5Q4 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
LMOD2Q6P5Q4 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
LMOD2Q6P5Q4 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
LMOD2Q6P5Q4 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
LMOD2Q6P5Q4 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
LMOD2Q6P5Q4 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
LMOD2Q6P5Q4 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
LMOD2Q6P5Q4 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
LMOD2Q6P5Q4 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
LMOD2Q6P5Q4 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
LMOD2Q6P5Q4 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
LMOD2Q6P5Q4 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
LMOD2Q6P5Q4 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
LMOD2Q6P5Q4 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.5
LMOD2Q6P5Q4 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
LMOD2Q6P5Q4 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
LMOD2Q6P5Q4 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
LMOD2Q6P5Q4 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
LMOD2Q6P5Q4 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
LMOD2Q6P5Q4 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
LMOD2Q6P5Q4 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
LMOD2Q6P5Q4 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
LMOD2Q6P5Q4 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
LMOD2Q6P5Q4 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC24.39■■□□□ 1.49
LMOD2Q6P5Q4 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
LMOD2Q6P5Q4 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
LMOD2Q6P5Q4 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
LMOD2Q6P5Q4 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
LMOD2Q6P5Q4 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
LMOD2Q6P5Q4 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
LMOD2Q6P5Q4 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
LMOD2Q6P5Q4 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
LMOD2Q6P5Q4 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
LMOD2Q6P5Q4 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
LMOD2Q6P5Q4 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
LMOD2Q6P5Q4 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
LMOD2Q6P5Q4 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
LMOD2Q6P5Q4 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
LMOD2Q6P5Q4 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
LMOD2Q6P5Q4 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
LMOD2Q6P5Q4 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC24.38■■□□□ 1.49
LMOD2Q6P5Q4 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
LMOD2Q6P5Q4 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
LMOD2Q6P5Q4 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
LMOD2Q6P5Q4 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
LMOD2Q6P5Q4 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
LMOD2Q6P5Q4 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.1 ms