Protein–RNA interactions for Protein: Q6NT89

TRNP1, TMF-regulated nuclear protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRNP1Q6NT89 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TRNP1Q6NT89 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TRNP1Q6NT89 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
TRNP1Q6NT89 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
TRNP1Q6NT89 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TRNP1Q6NT89 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
TRNP1Q6NT89 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TRNP1Q6NT89 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TRNP1Q6NT89 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TRNP1Q6NT89 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TRNP1Q6NT89 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TRNP1Q6NT89 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
TRNP1Q6NT89 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TRNP1Q6NT89 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
TRNP1Q6NT89 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TRNP1Q6NT89 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TRNP1Q6NT89 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TRNP1Q6NT89 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TRNP1Q6NT89 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
TRNP1Q6NT89 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
TRNP1Q6NT89 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
TRNP1Q6NT89 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
TRNP1Q6NT89 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TRNP1Q6NT89 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TRNP1Q6NT89 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
TRNP1Q6NT89 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
TRNP1Q6NT89 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TRNP1Q6NT89 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TRNP1Q6NT89 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TRNP1Q6NT89 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TRNP1Q6NT89 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
TRNP1Q6NT89 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TRNP1Q6NT89 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TRNP1Q6NT89 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
TRNP1Q6NT89 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
TRNP1Q6NT89 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
TRNP1Q6NT89 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
TRNP1Q6NT89 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.77■□□□□ 0.6
TRNP1Q6NT89 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
TRNP1Q6NT89 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
TRNP1Q6NT89 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
TRNP1Q6NT89 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
TRNP1Q6NT89 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
TRNP1Q6NT89 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
TRNP1Q6NT89 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
TRNP1Q6NT89 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
TRNP1Q6NT89 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
TRNP1Q6NT89 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
TRNP1Q6NT89 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
TRNP1Q6NT89 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
TRNP1Q6NT89 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
TRNP1Q6NT89 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
TRNP1Q6NT89 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
TRNP1Q6NT89 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
TRNP1Q6NT89 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
TRNP1Q6NT89 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
TRNP1Q6NT89 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
TRNP1Q6NT89 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
TRNP1Q6NT89 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
TRNP1Q6NT89 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
TRNP1Q6NT89 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
TRNP1Q6NT89 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
TRNP1Q6NT89 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TRNP1Q6NT89 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TRNP1Q6NT89 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TRNP1Q6NT89 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TRNP1Q6NT89 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TRNP1Q6NT89 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TRNP1Q6NT89 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
TRNP1Q6NT89 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TRNP1Q6NT89 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TRNP1Q6NT89 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TRNP1Q6NT89 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TRNP1Q6NT89 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TRNP1Q6NT89 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TRNP1Q6NT89 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TRNP1Q6NT89 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TRNP1Q6NT89 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TRNP1Q6NT89 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TRNP1Q6NT89 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TRNP1Q6NT89 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TRNP1Q6NT89 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
TRNP1Q6NT89 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TRNP1Q6NT89 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TRNP1Q6NT89 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TRNP1Q6NT89 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TRNP1Q6NT89 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TRNP1Q6NT89 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TRNP1Q6NT89 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
TRNP1Q6NT89 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TRNP1Q6NT89 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TRNP1Q6NT89 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TRNP1Q6NT89 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TRNP1Q6NT89 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TRNP1Q6NT89 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TRNP1Q6NT89 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
TRNP1Q6NT89 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TRNP1Q6NT89 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
TRNP1Q6NT89 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TRNP1Q6NT89 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.9 ms