Protein–RNA interactions for Protein: Q6DD88

ATL3, Atlastin-3, humanhuman

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATL3Q6DD88 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
ATL3Q6DD88 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ATL3Q6DD88 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ATL3Q6DD88 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ATL3Q6DD88 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
ATL3Q6DD88 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
ATL3Q6DD88 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ATL3Q6DD88 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ATL3Q6DD88 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ATL3Q6DD88 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
ATL3Q6DD88 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
ATL3Q6DD88 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
ATL3Q6DD88 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ATL3Q6DD88 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ATL3Q6DD88 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
ATL3Q6DD88 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
ATL3Q6DD88 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
ATL3Q6DD88 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ATL3Q6DD88 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ATL3Q6DD88 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ATL3Q6DD88 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ATL3Q6DD88 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
ATL3Q6DD88 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
ATL3Q6DD88 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
ATL3Q6DD88 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
ATL3Q6DD88 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
ATL3Q6DD88 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ATL3Q6DD88 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ATL3Q6DD88 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ATL3Q6DD88 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
ATL3Q6DD88 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
ATL3Q6DD88 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ATL3Q6DD88 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ATL3Q6DD88 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ATL3Q6DD88 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ATL3Q6DD88 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
ATL3Q6DD88 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
ATL3Q6DD88 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
ATL3Q6DD88 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ATL3Q6DD88 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ATL3Q6DD88 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ATL3Q6DD88 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ATL3Q6DD88 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ATL3Q6DD88 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ATL3Q6DD88 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ATL3Q6DD88 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ATL3Q6DD88 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
ATL3Q6DD88 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ATL3Q6DD88 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ATL3Q6DD88 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ATL3Q6DD88 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ATL3Q6DD88 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ATL3Q6DD88 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ATL3Q6DD88 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
ATL3Q6DD88 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ATL3Q6DD88 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ATL3Q6DD88 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ATL3Q6DD88 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ATL3Q6DD88 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ATL3Q6DD88 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ATL3Q6DD88 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ATL3Q6DD88 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ATL3Q6DD88 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ATL3Q6DD88 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ATL3Q6DD88 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ATL3Q6DD88 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ATL3Q6DD88 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ATL3Q6DD88 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ATL3Q6DD88 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ATL3Q6DD88 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ATL3Q6DD88 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ATL3Q6DD88 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ATL3Q6DD88 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ATL3Q6DD88 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ATL3Q6DD88 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ATL3Q6DD88 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
ATL3Q6DD88 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ATL3Q6DD88 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ATL3Q6DD88 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
ATL3Q6DD88 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
ATL3Q6DD88 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ATL3Q6DD88 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ATL3Q6DD88 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ATL3Q6DD88 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ATL3Q6DD88 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ATL3Q6DD88 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ATL3Q6DD88 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ATL3Q6DD88 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ATL3Q6DD88 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ATL3Q6DD88 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ATL3Q6DD88 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ATL3Q6DD88 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ATL3Q6DD88 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ATL3Q6DD88 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ATL3Q6DD88 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ATL3Q6DD88 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ATL3Q6DD88 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ATL3Q6DD88 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ATL3Q6DD88 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ATL3Q6DD88 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms