Protein–RNA interactions for Protein: Q676U5

ATG16L1, Autophagy-related protein 16-1, humanhuman

Predictions only

Length 607 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG16L1Q676U5 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ATG16L1Q676U5 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ATG16L1Q676U5 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ATG16L1Q676U5 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ATG16L1Q676U5 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ATG16L1Q676U5 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ATG16L1Q676U5 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ATG16L1Q676U5 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ATG16L1Q676U5 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ATG16L1Q676U5 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ATG16L1Q676U5 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ATG16L1Q676U5 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ATG16L1Q676U5 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
ATG16L1Q676U5 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ATG16L1Q676U5 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ATG16L1Q676U5 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ATG16L1Q676U5 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
ATG16L1Q676U5 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ATG16L1Q676U5 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ATG16L1Q676U5 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
ATG16L1Q676U5 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ATG16L1Q676U5 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ATG16L1Q676U5 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ATG16L1Q676U5 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ATG16L1Q676U5 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ATG16L1Q676U5 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ATG16L1Q676U5 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ATG16L1Q676U5 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ATG16L1Q676U5 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ATG16L1Q676U5 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
ATG16L1Q676U5 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ATG16L1Q676U5 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ATG16L1Q676U5 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ATG16L1Q676U5 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ATG16L1Q676U5 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
ATG16L1Q676U5 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ATG16L1Q676U5 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ATG16L1Q676U5 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ATG16L1Q676U5 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ATG16L1Q676U5 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ATG16L1Q676U5 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ATG16L1Q676U5 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ATG16L1Q676U5 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ATG16L1Q676U5 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ATG16L1Q676U5 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ATG16L1Q676U5 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
ATG16L1Q676U5 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
ATG16L1Q676U5 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ATG16L1Q676U5 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
ATG16L1Q676U5 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ATG16L1Q676U5 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
ATG16L1Q676U5 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ATG16L1Q676U5 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ATG16L1Q676U5 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ATG16L1Q676U5 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ATG16L1Q676U5 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
ATG16L1Q676U5 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ATG16L1Q676U5 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ATG16L1Q676U5 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ATG16L1Q676U5 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ATG16L1Q676U5 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ATG16L1Q676U5 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ATG16L1Q676U5 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ATG16L1Q676U5 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ATG16L1Q676U5 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ATG16L1Q676U5 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ATG16L1Q676U5 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ATG16L1Q676U5 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ATG16L1Q676U5 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ATG16L1Q676U5 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ATG16L1Q676U5 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ATG16L1Q676U5 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ATG16L1Q676U5 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ATG16L1Q676U5 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ATG16L1Q676U5 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ATG16L1Q676U5 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ATG16L1Q676U5 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ATG16L1Q676U5 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ATG16L1Q676U5 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ATG16L1Q676U5 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
ATG16L1Q676U5 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ATG16L1Q676U5 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
ATG16L1Q676U5 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ATG16L1Q676U5 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ATG16L1Q676U5 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ATG16L1Q676U5 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ATG16L1Q676U5 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ATG16L1Q676U5 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ATG16L1Q676U5 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ATG16L1Q676U5 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ATG16L1Q676U5 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ATG16L1Q676U5 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ATG16L1Q676U5 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ATG16L1Q676U5 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ATG16L1Q676U5 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ATG16L1Q676U5 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ATG16L1Q676U5 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ATG16L1Q676U5 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ATG16L1Q676U5 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ATG16L1Q676U5 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.7 ms