Protein–RNA interactions for Protein: Q5XPI4

RNF123, E3 ubiquitin-protein ligase RNF123, humanhuman

Predictions only

Length 1,314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF123Q5XPI4 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RNF123Q5XPI4 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RNF123Q5XPI4 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RNF123Q5XPI4 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
RNF123Q5XPI4 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RNF123Q5XPI4 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RNF123Q5XPI4 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RNF123Q5XPI4 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RNF123Q5XPI4 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RNF123Q5XPI4 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RNF123Q5XPI4 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RNF123Q5XPI4 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
RNF123Q5XPI4 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
RNF123Q5XPI4 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
RNF123Q5XPI4 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RNF123Q5XPI4 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RNF123Q5XPI4 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
RNF123Q5XPI4 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RNF123Q5XPI4 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RNF123Q5XPI4 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RNF123Q5XPI4 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
RNF123Q5XPI4 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RNF123Q5XPI4 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
RNF123Q5XPI4 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
RNF123Q5XPI4 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
RNF123Q5XPI4 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RNF123Q5XPI4 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RNF123Q5XPI4 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RNF123Q5XPI4 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RNF123Q5XPI4 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RNF123Q5XPI4 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
RNF123Q5XPI4 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
RNF123Q5XPI4 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
RNF123Q5XPI4 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
RNF123Q5XPI4 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RNF123Q5XPI4 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
RNF123Q5XPI4 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
RNF123Q5XPI4 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RNF123Q5XPI4 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RNF123Q5XPI4 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RNF123Q5XPI4 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
RNF123Q5XPI4 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
RNF123Q5XPI4 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RNF123Q5XPI4 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
RNF123Q5XPI4 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RNF123Q5XPI4 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RNF123Q5XPI4 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RNF123Q5XPI4 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
RNF123Q5XPI4 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
RNF123Q5XPI4 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RNF123Q5XPI4 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
RNF123Q5XPI4 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
RNF123Q5XPI4 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RNF123Q5XPI4 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RNF123Q5XPI4 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
RNF123Q5XPI4 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RNF123Q5XPI4 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RNF123Q5XPI4 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
RNF123Q5XPI4 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
RNF123Q5XPI4 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RNF123Q5XPI4 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RNF123Q5XPI4 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RNF123Q5XPI4 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
RNF123Q5XPI4 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RNF123Q5XPI4 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RNF123Q5XPI4 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
RNF123Q5XPI4 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
RNF123Q5XPI4 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
RNF123Q5XPI4 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
RNF123Q5XPI4 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
RNF123Q5XPI4 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
RNF123Q5XPI4 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
RNF123Q5XPI4 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
RNF123Q5XPI4 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
RNF123Q5XPI4 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RNF123Q5XPI4 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
RNF123Q5XPI4 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RNF123Q5XPI4 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RNF123Q5XPI4 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RNF123Q5XPI4 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RNF123Q5XPI4 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RNF123Q5XPI4 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RNF123Q5XPI4 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RNF123Q5XPI4 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RNF123Q5XPI4 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RNF123Q5XPI4 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RNF123Q5XPI4 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
RNF123Q5XPI4 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RNF123Q5XPI4 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RNF123Q5XPI4 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
RNF123Q5XPI4 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RNF123Q5XPI4 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
RNF123Q5XPI4 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RNF123Q5XPI4 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
RNF123Q5XPI4 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
RNF123Q5XPI4 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RNF123Q5XPI4 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RNF123Q5XPI4 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
RNF123Q5XPI4 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RNF123Q5XPI4 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms