Protein–RNA interactions for Protein: Q5VW32

BROX, BRO1 domain-containing protein BROX, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BROXQ5VW32 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
BROXQ5VW32 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
BROXQ5VW32 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
BROXQ5VW32 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
BROXQ5VW32 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC17.74■□□□□ 0.43
BROXQ5VW32 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
BROXQ5VW32 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
BROXQ5VW32 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
BROXQ5VW32 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
BROXQ5VW32 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
BROXQ5VW32 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
BROXQ5VW32 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
BROXQ5VW32 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
BROXQ5VW32 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
BROXQ5VW32 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
BROXQ5VW32 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
BROXQ5VW32 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
BROXQ5VW32 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
BROXQ5VW32 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
BROXQ5VW32 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
BROXQ5VW32 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
BROXQ5VW32 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
BROXQ5VW32 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
BROXQ5VW32 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
BROXQ5VW32 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
BROXQ5VW32 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
BROXQ5VW32 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
BROXQ5VW32 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
BROXQ5VW32 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
BROXQ5VW32 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
BROXQ5VW32 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
BROXQ5VW32 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC17.73■□□□□ 0.43
BROXQ5VW32 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
BROXQ5VW32 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC17.73■□□□□ 0.43
BROXQ5VW32 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
BROXQ5VW32 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
BROXQ5VW32 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
BROXQ5VW32 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
BROXQ5VW32 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
BROXQ5VW32 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
BROXQ5VW32 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
BROXQ5VW32 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
BROXQ5VW32 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
BROXQ5VW32 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
BROXQ5VW32 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
BROXQ5VW32 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
BROXQ5VW32 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
BROXQ5VW32 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
BROXQ5VW32 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
BROXQ5VW32 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
BROXQ5VW32 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
BROXQ5VW32 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
BROXQ5VW32 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
BROXQ5VW32 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
BROXQ5VW32 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
BROXQ5VW32 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
BROXQ5VW32 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
BROXQ5VW32 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
BROXQ5VW32 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
BROXQ5VW32 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
BROXQ5VW32 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
BROXQ5VW32 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC17.72■□□□□ 0.43
BROXQ5VW32 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
BROXQ5VW32 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
BROXQ5VW32 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
BROXQ5VW32 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
BROXQ5VW32 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
BROXQ5VW32 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
BROXQ5VW32 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
BROXQ5VW32 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
BROXQ5VW32 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
BROXQ5VW32 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
BROXQ5VW32 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
BROXQ5VW32 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
BROXQ5VW32 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
BROXQ5VW32 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
BROXQ5VW32 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
BROXQ5VW32 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
BROXQ5VW32 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
BROXQ5VW32 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
BROXQ5VW32 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
BROXQ5VW32 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
BROXQ5VW32 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
BROXQ5VW32 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
BROXQ5VW32 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
BROXQ5VW32 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
BROXQ5VW32 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
BROXQ5VW32 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
BROXQ5VW32 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
BROXQ5VW32 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
BROXQ5VW32 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
BROXQ5VW32 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
BROXQ5VW32 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
BROXQ5VW32 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
BROXQ5VW32 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
BROXQ5VW32 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
BROXQ5VW32 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.42
BROXQ5VW32 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.42
BROXQ5VW32 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
BROXQ5VW32 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms