Protein–RNA interactions for Protein: Q5VUJ6

LRCH2, Leucine-rich repeat and calponin homology domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 765 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRCH2Q5VUJ6 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
LRCH2Q5VUJ6 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
LRCH2Q5VUJ6 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
LRCH2Q5VUJ6 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
LRCH2Q5VUJ6 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
LRCH2Q5VUJ6 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
LRCH2Q5VUJ6 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
LRCH2Q5VUJ6 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
LRCH2Q5VUJ6 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
LRCH2Q5VUJ6 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
LRCH2Q5VUJ6 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
LRCH2Q5VUJ6 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
LRCH2Q5VUJ6 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
LRCH2Q5VUJ6 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
LRCH2Q5VUJ6 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
LRCH2Q5VUJ6 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
LRCH2Q5VUJ6 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
LRCH2Q5VUJ6 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
LRCH2Q5VUJ6 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
LRCH2Q5VUJ6 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.85
LRCH2Q5VUJ6 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.85
LRCH2Q5VUJ6 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
LRCH2Q5VUJ6 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
LRCH2Q5VUJ6 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
LRCH2Q5VUJ6 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
LRCH2Q5VUJ6 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
LRCH2Q5VUJ6 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
LRCH2Q5VUJ6 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
LRCH2Q5VUJ6 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
LRCH2Q5VUJ6 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
LRCH2Q5VUJ6 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
LRCH2Q5VUJ6 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
LRCH2Q5VUJ6 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
LRCH2Q5VUJ6 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
LRCH2Q5VUJ6 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
LRCH2Q5VUJ6 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
LRCH2Q5VUJ6 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.85
LRCH2Q5VUJ6 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
LRCH2Q5VUJ6 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
LRCH2Q5VUJ6 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
LRCH2Q5VUJ6 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
LRCH2Q5VUJ6 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
LRCH2Q5VUJ6 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
LRCH2Q5VUJ6 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
LRCH2Q5VUJ6 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
LRCH2Q5VUJ6 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
LRCH2Q5VUJ6 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
LRCH2Q5VUJ6 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
LRCH2Q5VUJ6 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
LRCH2Q5VUJ6 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
LRCH2Q5VUJ6 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
LRCH2Q5VUJ6 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
LRCH2Q5VUJ6 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
LRCH2Q5VUJ6 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
LRCH2Q5VUJ6 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
LRCH2Q5VUJ6 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
LRCH2Q5VUJ6 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
LRCH2Q5VUJ6 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
LRCH2Q5VUJ6 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
LRCH2Q5VUJ6 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
LRCH2Q5VUJ6 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
LRCH2Q5VUJ6 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
LRCH2Q5VUJ6 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
LRCH2Q5VUJ6 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
LRCH2Q5VUJ6 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
LRCH2Q5VUJ6 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
LRCH2Q5VUJ6 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
LRCH2Q5VUJ6 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
LRCH2Q5VUJ6 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
LRCH2Q5VUJ6 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
LRCH2Q5VUJ6 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
LRCH2Q5VUJ6 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
LRCH2Q5VUJ6 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
LRCH2Q5VUJ6 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
LRCH2Q5VUJ6 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
LRCH2Q5VUJ6 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
LRCH2Q5VUJ6 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
LRCH2Q5VUJ6 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
LRCH2Q5VUJ6 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
LRCH2Q5VUJ6 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
LRCH2Q5VUJ6 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
LRCH2Q5VUJ6 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
LRCH2Q5VUJ6 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
LRCH2Q5VUJ6 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
LRCH2Q5VUJ6 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
LRCH2Q5VUJ6 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
LRCH2Q5VUJ6 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
LRCH2Q5VUJ6 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
LRCH2Q5VUJ6 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
LRCH2Q5VUJ6 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
LRCH2Q5VUJ6 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
LRCH2Q5VUJ6 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
LRCH2Q5VUJ6 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
LRCH2Q5VUJ6 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
LRCH2Q5VUJ6 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
LRCH2Q5VUJ6 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
LRCH2Q5VUJ6 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
LRCH2Q5VUJ6 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
LRCH2Q5VUJ6 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
LRCH2Q5VUJ6 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68 ms