Protein–RNA interactions for Protein: Q5SR53

PIK3CD-AS1, Putative uncharacterized protein PIK3CD-AS1, humanhuman

Predictions only

Length 167 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIK3CD-AS1Q5SR53 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
PIK3CD-AS1Q5SR53 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
PIK3CD-AS1Q5SR53 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
PIK3CD-AS1Q5SR53 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
PIK3CD-AS1Q5SR53 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
PIK3CD-AS1Q5SR53 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
PIK3CD-AS1Q5SR53 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
PIK3CD-AS1Q5SR53 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC12.96□□□□□ -0.33
PIK3CD-AS1Q5SR53 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
PIK3CD-AS1Q5SR53 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
PIK3CD-AS1Q5SR53 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC12.96□□□□□ -0.33
PIK3CD-AS1Q5SR53 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
PIK3CD-AS1Q5SR53 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC12.96□□□□□ -0.33
PIK3CD-AS1Q5SR53 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
PIK3CD-AS1Q5SR53 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
PIK3CD-AS1Q5SR53 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
PIK3CD-AS1Q5SR53 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
PIK3CD-AS1Q5SR53 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
PIK3CD-AS1Q5SR53 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
PIK3CD-AS1Q5SR53 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC12.96□□□□□ -0.34
PIK3CD-AS1Q5SR53 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.34
PIK3CD-AS1Q5SR53 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
PIK3CD-AS1Q5SR53 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
PIK3CD-AS1Q5SR53 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
PIK3CD-AS1Q5SR53 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
PIK3CD-AS1Q5SR53 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
PIK3CD-AS1Q5SR53 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
PIK3CD-AS1Q5SR53 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
PIK3CD-AS1Q5SR53 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
PIK3CD-AS1Q5SR53 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
PIK3CD-AS1Q5SR53 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
PIK3CD-AS1Q5SR53 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
PIK3CD-AS1Q5SR53 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
PIK3CD-AS1Q5SR53 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
PIK3CD-AS1Q5SR53 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
PIK3CD-AS1Q5SR53 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
PIK3CD-AS1Q5SR53 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
PIK3CD-AS1Q5SR53 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
PIK3CD-AS1Q5SR53 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
PIK3CD-AS1Q5SR53 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
PIK3CD-AS1Q5SR53 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
PIK3CD-AS1Q5SR53 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
PIK3CD-AS1Q5SR53 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
PIK3CD-AS1Q5SR53 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
PIK3CD-AS1Q5SR53 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
PIK3CD-AS1Q5SR53 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
PIK3CD-AS1Q5SR53 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
PIK3CD-AS1Q5SR53 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
PIK3CD-AS1Q5SR53 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
PIK3CD-AS1Q5SR53 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
PIK3CD-AS1Q5SR53 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
PIK3CD-AS1Q5SR53 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
PIK3CD-AS1Q5SR53 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
PIK3CD-AS1Q5SR53 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
PIK3CD-AS1Q5SR53 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
PIK3CD-AS1Q5SR53 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
PIK3CD-AS1Q5SR53 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
PIK3CD-AS1Q5SR53 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
PIK3CD-AS1Q5SR53 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
PIK3CD-AS1Q5SR53 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
PIK3CD-AS1Q5SR53 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
PIK3CD-AS1Q5SR53 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
PIK3CD-AS1Q5SR53 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
PIK3CD-AS1Q5SR53 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
PIK3CD-AS1Q5SR53 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
PIK3CD-AS1Q5SR53 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC12.95□□□□□ -0.34
PIK3CD-AS1Q5SR53 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
PIK3CD-AS1Q5SR53 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
PIK3CD-AS1Q5SR53 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
PIK3CD-AS1Q5SR53 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
PIK3CD-AS1Q5SR53 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
PIK3CD-AS1Q5SR53 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
PIK3CD-AS1Q5SR53 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
PIK3CD-AS1Q5SR53 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
PIK3CD-AS1Q5SR53 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
PIK3CD-AS1Q5SR53 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
PIK3CD-AS1Q5SR53 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
PIK3CD-AS1Q5SR53 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
PIK3CD-AS1Q5SR53 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
PIK3CD-AS1Q5SR53 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
PIK3CD-AS1Q5SR53 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
PIK3CD-AS1Q5SR53 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
PIK3CD-AS1Q5SR53 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC12.94□□□□□ -0.34
PIK3CD-AS1Q5SR53 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
PIK3CD-AS1Q5SR53 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
PIK3CD-AS1Q5SR53 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
PIK3CD-AS1Q5SR53 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
PIK3CD-AS1Q5SR53 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
PIK3CD-AS1Q5SR53 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
PIK3CD-AS1Q5SR53 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
PIK3CD-AS1Q5SR53 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
PIK3CD-AS1Q5SR53 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
PIK3CD-AS1Q5SR53 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
PIK3CD-AS1Q5SR53 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
PIK3CD-AS1Q5SR53 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
PIK3CD-AS1Q5SR53 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
PIK3CD-AS1Q5SR53 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
PIK3CD-AS1Q5SR53 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
PIK3CD-AS1Q5SR53 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
PIK3CD-AS1Q5SR53 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.4 ms