Protein–RNA interactions for Protein: Q5JU00

TCTE1, T-complex-associated testis-expressed protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 501 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCTE1Q5JU00 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TCTE1Q5JU00 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TCTE1Q5JU00 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TCTE1Q5JU00 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TCTE1Q5JU00 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TCTE1Q5JU00 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TCTE1Q5JU00 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TCTE1Q5JU00 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TCTE1Q5JU00 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TCTE1Q5JU00 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TCTE1Q5JU00 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TCTE1Q5JU00 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TCTE1Q5JU00 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
TCTE1Q5JU00 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TCTE1Q5JU00 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TCTE1Q5JU00 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TCTE1Q5JU00 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TCTE1Q5JU00 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TCTE1Q5JU00 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TCTE1Q5JU00 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TCTE1Q5JU00 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TCTE1Q5JU00 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TCTE1Q5JU00 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TCTE1Q5JU00 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TCTE1Q5JU00 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TCTE1Q5JU00 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
TCTE1Q5JU00 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TCTE1Q5JU00 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
TCTE1Q5JU00 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TCTE1Q5JU00 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TCTE1Q5JU00 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TCTE1Q5JU00 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TCTE1Q5JU00 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TCTE1Q5JU00 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TCTE1Q5JU00 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
TCTE1Q5JU00 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
TCTE1Q5JU00 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TCTE1Q5JU00 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TCTE1Q5JU00 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TCTE1Q5JU00 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TCTE1Q5JU00 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TCTE1Q5JU00 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TCTE1Q5JU00 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TCTE1Q5JU00 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TCTE1Q5JU00 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TCTE1Q5JU00 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TCTE1Q5JU00 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TCTE1Q5JU00 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
TCTE1Q5JU00 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
TCTE1Q5JU00 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TCTE1Q5JU00 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TCTE1Q5JU00 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TCTE1Q5JU00 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TCTE1Q5JU00 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TCTE1Q5JU00 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TCTE1Q5JU00 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TCTE1Q5JU00 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TCTE1Q5JU00 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TCTE1Q5JU00 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TCTE1Q5JU00 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TCTE1Q5JU00 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TCTE1Q5JU00 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TCTE1Q5JU00 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TCTE1Q5JU00 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TCTE1Q5JU00 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TCTE1Q5JU00 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TCTE1Q5JU00 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TCTE1Q5JU00 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TCTE1Q5JU00 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TCTE1Q5JU00 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TCTE1Q5JU00 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TCTE1Q5JU00 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TCTE1Q5JU00 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TCTE1Q5JU00 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TCTE1Q5JU00 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TCTE1Q5JU00 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TCTE1Q5JU00 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TCTE1Q5JU00 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TCTE1Q5JU00 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TCTE1Q5JU00 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TCTE1Q5JU00 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
TCTE1Q5JU00 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TCTE1Q5JU00 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TCTE1Q5JU00 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TCTE1Q5JU00 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TCTE1Q5JU00 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TCTE1Q5JU00 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TCTE1Q5JU00 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TCTE1Q5JU00 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TCTE1Q5JU00 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TCTE1Q5JU00 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TCTE1Q5JU00 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TCTE1Q5JU00 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TCTE1Q5JU00 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TCTE1Q5JU00 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TCTE1Q5JU00 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TCTE1Q5JU00 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TCTE1Q5JU00 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TCTE1Q5JU00 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TCTE1Q5JU00 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms