Protein–RNA interactions for Protein: Q5BJE1

CCDC178, Coiled-coil domain-containing protein 178, humanhuman

Predictions only

Length 867 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC178Q5BJE1 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC178Q5BJE1 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CCDC178Q5BJE1 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CCDC178Q5BJE1 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CCDC178Q5BJE1 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CCDC178Q5BJE1 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CCDC178Q5BJE1 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CCDC178Q5BJE1 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CCDC178Q5BJE1 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CCDC178Q5BJE1 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CCDC178Q5BJE1 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CCDC178Q5BJE1 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CCDC178Q5BJE1 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CCDC178Q5BJE1 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CCDC178Q5BJE1 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CCDC178Q5BJE1 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CCDC178Q5BJE1 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CCDC178Q5BJE1 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CCDC178Q5BJE1 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CCDC178Q5BJE1 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CCDC178Q5BJE1 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CCDC178Q5BJE1 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CCDC178Q5BJE1 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
CCDC178Q5BJE1 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
CCDC178Q5BJE1 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
CCDC178Q5BJE1 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
CCDC178Q5BJE1 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
CCDC178Q5BJE1 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
CCDC178Q5BJE1 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
CCDC178Q5BJE1 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
CCDC178Q5BJE1 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
CCDC178Q5BJE1 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
CCDC178Q5BJE1 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC178Q5BJE1 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC178Q5BJE1 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC178Q5BJE1 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC178Q5BJE1 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC178Q5BJE1 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC178Q5BJE1 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC178Q5BJE1 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC178Q5BJE1 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC178Q5BJE1 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC178Q5BJE1 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC178Q5BJE1 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC178Q5BJE1 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC178Q5BJE1 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC178Q5BJE1 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC178Q5BJE1 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC178Q5BJE1 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC178Q5BJE1 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC178Q5BJE1 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC178Q5BJE1 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC178Q5BJE1 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC178Q5BJE1 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC178Q5BJE1 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC178Q5BJE1 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC178Q5BJE1 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC178Q5BJE1 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC178Q5BJE1 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC178Q5BJE1 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC178Q5BJE1 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CCDC178Q5BJE1 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CCDC178Q5BJE1 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CCDC178Q5BJE1 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CCDC178Q5BJE1 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CCDC178Q5BJE1 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CCDC178Q5BJE1 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CCDC178Q5BJE1 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CCDC178Q5BJE1 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CCDC178Q5BJE1 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
CCDC178Q5BJE1 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CCDC178Q5BJE1 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CCDC178Q5BJE1 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CCDC178Q5BJE1 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CCDC178Q5BJE1 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CCDC178Q5BJE1 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CCDC178Q5BJE1 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CCDC178Q5BJE1 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CCDC178Q5BJE1 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CCDC178Q5BJE1 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CCDC178Q5BJE1 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CCDC178Q5BJE1 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CCDC178Q5BJE1 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CCDC178Q5BJE1 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
CCDC178Q5BJE1 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CCDC178Q5BJE1 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CCDC178Q5BJE1 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CCDC178Q5BJE1 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CCDC178Q5BJE1 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CCDC178Q5BJE1 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CCDC178Q5BJE1 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CCDC178Q5BJE1 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CCDC178Q5BJE1 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CCDC178Q5BJE1 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CCDC178Q5BJE1 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CCDC178Q5BJE1 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
CCDC178Q5BJE1 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CCDC178Q5BJE1 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CCDC178Q5BJE1 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CCDC178Q5BJE1 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40 ms