Protein–RNA interactions for Protein: Q4VX76

SYTL3, Synaptotagmin-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 610 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYTL3Q4VX76 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
SYTL3Q4VX76 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SYTL3Q4VX76 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SYTL3Q4VX76 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SYTL3Q4VX76 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SYTL3Q4VX76 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SYTL3Q4VX76 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SYTL3Q4VX76 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SYTL3Q4VX76 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SYTL3Q4VX76 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SYTL3Q4VX76 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SYTL3Q4VX76 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SYTL3Q4VX76 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SYTL3Q4VX76 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SYTL3Q4VX76 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SYTL3Q4VX76 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SYTL3Q4VX76 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SYTL3Q4VX76 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SYTL3Q4VX76 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SYTL3Q4VX76 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SYTL3Q4VX76 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SYTL3Q4VX76 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SYTL3Q4VX76 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SYTL3Q4VX76 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SYTL3Q4VX76 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SYTL3Q4VX76 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SYTL3Q4VX76 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SYTL3Q4VX76 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SYTL3Q4VX76 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SYTL3Q4VX76 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SYTL3Q4VX76 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SYTL3Q4VX76 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
SYTL3Q4VX76 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SYTL3Q4VX76 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SYTL3Q4VX76 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SYTL3Q4VX76 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SYTL3Q4VX76 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SYTL3Q4VX76 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SYTL3Q4VX76 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SYTL3Q4VX76 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SYTL3Q4VX76 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SYTL3Q4VX76 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
SYTL3Q4VX76 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SYTL3Q4VX76 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SYTL3Q4VX76 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SYTL3Q4VX76 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SYTL3Q4VX76 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SYTL3Q4VX76 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SYTL3Q4VX76 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
SYTL3Q4VX76 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SYTL3Q4VX76 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SYTL3Q4VX76 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SYTL3Q4VX76 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SYTL3Q4VX76 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SYTL3Q4VX76 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SYTL3Q4VX76 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SYTL3Q4VX76 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SYTL3Q4VX76 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SYTL3Q4VX76 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SYTL3Q4VX76 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SYTL3Q4VX76 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SYTL3Q4VX76 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SYTL3Q4VX76 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SYTL3Q4VX76 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SYTL3Q4VX76 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SYTL3Q4VX76 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SYTL3Q4VX76 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
SYTL3Q4VX76 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SYTL3Q4VX76 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
SYTL3Q4VX76 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SYTL3Q4VX76 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SYTL3Q4VX76 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
SYTL3Q4VX76 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SYTL3Q4VX76 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SYTL3Q4VX76 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SYTL3Q4VX76 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
SYTL3Q4VX76 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
SYTL3Q4VX76 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SYTL3Q4VX76 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SYTL3Q4VX76 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SYTL3Q4VX76 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
SYTL3Q4VX76 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SYTL3Q4VX76 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SYTL3Q4VX76 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SYTL3Q4VX76 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SYTL3Q4VX76 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SYTL3Q4VX76 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SYTL3Q4VX76 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SYTL3Q4VX76 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SYTL3Q4VX76 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SYTL3Q4VX76 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SYTL3Q4VX76 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SYTL3Q4VX76 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SYTL3Q4VX76 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SYTL3Q4VX76 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SYTL3Q4VX76 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SYTL3Q4VX76 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SYTL3Q4VX76 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SYTL3Q4VX76 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
SYTL3Q4VX76 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.9 ms