Protein–RNA interactions for Protein: Q4LDR2

CTXN3, Cortexin-3, humanhuman

Predictions only

Length 81 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTXN3Q4LDR2 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CTXN3Q4LDR2 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CTXN3Q4LDR2 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CTXN3Q4LDR2 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
CTXN3Q4LDR2 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CTXN3Q4LDR2 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CTXN3Q4LDR2 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CTXN3Q4LDR2 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CTXN3Q4LDR2 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CTXN3Q4LDR2 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CTXN3Q4LDR2 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CTXN3Q4LDR2 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CTXN3Q4LDR2 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CTXN3Q4LDR2 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CTXN3Q4LDR2 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CTXN3Q4LDR2 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CTXN3Q4LDR2 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CTXN3Q4LDR2 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CTXN3Q4LDR2 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CTXN3Q4LDR2 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CTXN3Q4LDR2 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CTXN3Q4LDR2 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CTXN3Q4LDR2 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CTXN3Q4LDR2 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CTXN3Q4LDR2 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CTXN3Q4LDR2 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CTXN3Q4LDR2 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CTXN3Q4LDR2 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CTXN3Q4LDR2 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CTXN3Q4LDR2 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CTXN3Q4LDR2 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
CTXN3Q4LDR2 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CTXN3Q4LDR2 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CTXN3Q4LDR2 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CTXN3Q4LDR2 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
CTXN3Q4LDR2 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CTXN3Q4LDR2 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CTXN3Q4LDR2 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CTXN3Q4LDR2 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CTXN3Q4LDR2 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CTXN3Q4LDR2 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CTXN3Q4LDR2 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CTXN3Q4LDR2 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
CTXN3Q4LDR2 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CTXN3Q4LDR2 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
CTXN3Q4LDR2 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CTXN3Q4LDR2 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
CTXN3Q4LDR2 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CTXN3Q4LDR2 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CTXN3Q4LDR2 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CTXN3Q4LDR2 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
CTXN3Q4LDR2 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CTXN3Q4LDR2 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CTXN3Q4LDR2 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CTXN3Q4LDR2 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CTXN3Q4LDR2 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CTXN3Q4LDR2 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CTXN3Q4LDR2 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CTXN3Q4LDR2 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CTXN3Q4LDR2 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CTXN3Q4LDR2 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CTXN3Q4LDR2 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CTXN3Q4LDR2 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CTXN3Q4LDR2 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CTXN3Q4LDR2 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CTXN3Q4LDR2 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CTXN3Q4LDR2 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CTXN3Q4LDR2 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CTXN3Q4LDR2 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CTXN3Q4LDR2 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CTXN3Q4LDR2 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
CTXN3Q4LDR2 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CTXN3Q4LDR2 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CTXN3Q4LDR2 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CTXN3Q4LDR2 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
CTXN3Q4LDR2 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CTXN3Q4LDR2 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CTXN3Q4LDR2 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
CTXN3Q4LDR2 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CTXN3Q4LDR2 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CTXN3Q4LDR2 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CTXN3Q4LDR2 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CTXN3Q4LDR2 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CTXN3Q4LDR2 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CTXN3Q4LDR2 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CTXN3Q4LDR2 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CTXN3Q4LDR2 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CTXN3Q4LDR2 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
CTXN3Q4LDR2 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CTXN3Q4LDR2 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CTXN3Q4LDR2 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CTXN3Q4LDR2 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CTXN3Q4LDR2 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CTXN3Q4LDR2 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CTXN3Q4LDR2 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CTXN3Q4LDR2 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CTXN3Q4LDR2 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CTXN3Q4LDR2 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CTXN3Q4LDR2 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CTXN3Q4LDR2 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.3 ms