Protein–RNA interactions for Protein: Q494R4

CCDC153, Coiled-coil domain-containing protein 153, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC153Q494R4 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC153Q494R4 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC153Q494R4 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC153Q494R4 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC153Q494R4 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC153Q494R4 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC153Q494R4 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC153Q494R4 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC153Q494R4 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC153Q494R4 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC153Q494R4 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC153Q494R4 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC153Q494R4 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC153Q494R4 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC153Q494R4 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC153Q494R4 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC153Q494R4 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC153Q494R4 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC153Q494R4 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC153Q494R4 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC153Q494R4 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC153Q494R4 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC153Q494R4 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC153Q494R4 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC153Q494R4 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC153Q494R4 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC153Q494R4 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC153Q494R4 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC153Q494R4 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC153Q494R4 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC153Q494R4 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC153Q494R4 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC153Q494R4 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC153Q494R4 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC153Q494R4 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC153Q494R4 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC153Q494R4 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC153Q494R4 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC153Q494R4 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC153Q494R4 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC153Q494R4 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC153Q494R4 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC153Q494R4 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC153Q494R4 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC153Q494R4 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC153Q494R4 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC153Q494R4 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC153Q494R4 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC153Q494R4 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC153Q494R4 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC153Q494R4 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC153Q494R4 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC153Q494R4 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC153Q494R4 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC153Q494R4 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC153Q494R4 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC153Q494R4 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC153Q494R4 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC153Q494R4 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC153Q494R4 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC153Q494R4 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC153Q494R4 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC153Q494R4 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC153Q494R4 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC153Q494R4 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC153Q494R4 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC153Q494R4 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC153Q494R4 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC153Q494R4 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC153Q494R4 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC153Q494R4 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC153Q494R4 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC153Q494R4 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC153Q494R4 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC153Q494R4 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC153Q494R4 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC153Q494R4 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC153Q494R4 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC153Q494R4 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC153Q494R4 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC153Q494R4 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC153Q494R4 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC153Q494R4 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC153Q494R4 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC153Q494R4 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC153Q494R4 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC153Q494R4 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC153Q494R4 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC153Q494R4 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC153Q494R4 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC153Q494R4 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC153Q494R4 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC153Q494R4 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC153Q494R4 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC153Q494R4 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC153Q494R4 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC153Q494R4 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC153Q494R4 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC153Q494R4 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC153Q494R4 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.1 ms